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Gene

ICA1L

islet cell autoantigen 1 like

Sintesi

Localizzazione citogenetica
2q33.2
Coordinate
Cromosoma 2: 202.773.176–202.871.766 (GRCh38)
Esoni
13 esoni su 98,6 kb
Proteina
482 amminoacidi
Simboli precedenti
ALS2CR15, ALS2CR14
Trascritto MANE Select
ENST00000358299.7NM_001288622.3
Tipo di locus
Codificanti per proteine
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora ICA1L. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di ICA1L

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 2, con una parentesi dove si trova ICA1L. ICA1L e 7 geni nelle vicinanze sul cromosoma 2, da 202.322.471 a 203.322.470.Cromosoma 22q33.2p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23.3p23.2p23.1p22.3p22.2p22.1p21p16.3p16.2p16.1p15p14p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13q14.1q14.2q14.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q34q35q36.1q36.2q36.3q37.1q37.2q37.3202,4 Mb202,6 Mb202,8 Mb203 Mb203,2 MbBMPR2: 202.375.835–202.567.751, filamento direttoBMPR2: 202.377.112–202.377.168, filamento direttoFAM117B: 202.634.969–202.769.757, filamento direttoFAM117BICA1L: 202.773.176–202.871.766, filamento inversoICA1LWDR12: 202.874.261–203.014.798, filamento inversoWDR12CARF: 202.912.214–202.988.263, filamento direttoCARFNBEAL1: 203.014.608–203.226.378, filamento direttoNBEAL1CYP20A1: 203.238.952–203.306.026, filamento direttoCYP20A1Diagramma di ICA1L: 13 esoni sul filamento inverso del cromosoma 2Esone 13: 202.773.176–202.779.648, 6473 basiEsone 12: 202.785.918–202.786.007, 90 basiEsone 11: 202.788.830–202.789.087, 258 basiEsone 10: 202.796.890–202.796.964, 75 basiEsone 9: 202.811.746–202.811.789, 44 basiEsone 8: 202.814.702–202.814.784, 83 basiEsone 7: 202.815.911–202.816.009, 99 basiEsone 6: 202.817.418–202.817.543, 126 basiEsone 5: 202.819.701–202.819.899, 199 basiEsone 4: 202.821.358–202.821.481, 124 basiEsone 3: 202.825.695–202.825.767, 73 basiEsone 2: 202.828.848–202.829.016, 169 basiEsone 1: 202.871.619–202.871.766, 148 basi131210864215′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 8 kb dei 98,6 kb del gene; 1449 di queste basi codificano la proteina.

Sequenziamento di ICA1L

7Facile

Quanto è difficile sequenziare ICA1L con letture corte, su 100

Quasi tutti gli esoni di ICA1L si trovano in regioni in cui le letture corte si allineano in modo chiaro.

A ciò si aggiunge: la quota di esoni di ICA1L in ciascun tipo di regione difficile

  • Mappabilità2,4%
  • Omologia15%
  • Ripetizioni3,3%
  • Contenuto GC10%
  • Copertura del riferimento0%

Un punteggio di Dante Labs basato su nostre ricerche, costruito sulle mappe delle regioni difficili da sequenziare di NIST Genome in a Bottle.Come viene calcolato

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.

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Dante Labs. (s.d.). Gene ICA1L: islet cell autoantigen 1 like. Consultato il 18 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/ica1l

Vancouver

Dante Labs. Gene ICA1L: islet cell autoantigen 1 like [Internet]. [citato il 18 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/ica1l

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