Vai al contenuto
Usa i fondi del tuo conto HSA o FSA
Sequenzia il tuo genoma (si apre in una nuova scheda)

Gene

ARHGEF1

Rho guanine nucleotide exchange factor 1

Sintesi

Localizzazione citogenetica
19q13.2
Coordinate
Cromosoma 19: 41.883.184–41.907.452 (GRCh38)
Esoni
29 esoni su 24,3 kb
Proteina
912 amminoacidi
Noto anche come
P115-RHOGEF, SUB1.5, LBCL2
Trascritto MANE Select
ENST00000354532.8NM_004706.4
Tipo di locus
Codificanti per proteine
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora ARHGEF1. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di ARHGEF1

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 19, con una parentesi dove si trova ARHGEF1. ARHGEF1 e 36 geni nelle vicinanze sul cromosoma 19, da 41.395.318 a 42.395.317.Cromosoma 1919q13.2p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4341,4 Mb41,6 Mb41,8 Mb42 Mb42,2 Mb: 41.350.853–41.425.001, filamento direttoEXOSC5: 41.367.173–41.397.441, filamento inversoBCKDHA: 41.397.792–41.425.092, filamento direttoBCKDHAB3GNT8: 41.422.878–41.428.730, filamento inversoB3GNT8DMAC2: 41.431.317–41.440.717, filamento inversoDMAC2ERICH4: 41.443.152–41.444.765, filamento direttoERICH4CEACAM21: 41.549.518–41.586.844, filamento direttoCEACAM21CEACAM4: 41.619.014–41.627.082, filamento inversoCEACAM4CEACAM7: 41.666.629–41.706.976, filamento inversoCEACAM7CEACAM5: 41.708.585–41.730.519, filamento direttoCEACAM5: 41.708.657–41.756.737, filamento direttoCEACAM6: 41.750.977–41.772.211, filamento direttoCEACAM6CEACAM3: 41.796.587–41.811.557, filamento direttoCEACAM3LYPD4: 41.837.073–41.844.718, filamento inversoDMRTC2: 41.844.743–41.852.333, filamento direttoDMRTC2RPS19: 41.859.848–41.872.931, filamento direttoRPS19CD79A: 41.877.104–41.881.372, filamento direttoCD79AARHGEF1: 41.883.184–41.907.452, filamento direttoARHGEF1ERFL: 41.907.704–41.928.449, filamento inversoERFLRABAC1: 41.956.681–41.959.390, filamento inversoRABAC1: 41.956.879–41.994.232, filamento inversoATP1A3: 41.966.582–41.997.497, filamento inversoATP1A3GRIK5: 41.998.315–42.070.240, filamento inversoGRIK5ZNF574: 42.068.477–42.083.096, filamento direttoZNF574POU2F2: 42.086.110–42.196.585, filamento inversoPOU2F2DEDD2: 42.198.593–42.220.140, filamento inversoDEDD2: 42.215.133–42.232.149, filamento inversoZNF526: 42.216.774–42.231.887, filamento direttoZNF526GSK3A: 42.226.225–42.242.625, filamento inversoGSK3A: 42.234.583–42.255.132, filamento inversoERF: 42.247.569–42.255.172, filamento inversoCIC: 42.268.508–42.295.801, filamento direttoCICPAFAH1B3: 42.297.023–42.303.546, filamento inversoPAFAH1B3PRR19: 42.302.098–42.310.821, filamento direttoPRR19TMEM145: 42.313.299–42.325.064, filamento direttoTMEM145MEGF8: 42.325.518–42.378.769, filamento direttoMEGF8CNFN: 42.387.019–42.390.299, filamento inversoCNFNDiagramma di ARHGEF1: 29 esoni sul filamento diretto del cromosoma 19Esone 1: 41.883.184–41.883.289, 106 basiEsone 2: 41.888.064–41.888.106, 43 basiEsone 3: 41.888.192–41.888.278, 87 basiEsone 4: 41.888.752–41.888.865, 114 basiEsone 5: 41.892.025–41.892.123, 99 basiEsone 6: 41.892.331–41.892.373, 43 basiEsone 7: 41.892.603–41.892.849, 247 basiEsone 8: 41.893.274–41.893.303, 30 basiEsone 9: 41.894.207–41.894.306, 100 basiEsone 10: 41.894.451–41.894.547, 97 basiEsone 11: 41.894.626–41.894.661, 36 basiEsone 12: 41.895.349–41.895.486, 138 basiEsone 13: 41.896.377–41.896.482, 106 basiEsone 14: 41.898.442–41.898.587, 146 basiEsone 15: 41.901.887–41.902.033, 147 basiEsone 16: 41.902.274–41.902.356, 83 basiEsone 17: 41.902.533–41.902.658, 126 basiEsone 18: 41.902.784–41.902.898, 115 basiEsone 19: 41.903.307–41.903.407, 101 basiEsone 20: 41.903.707–41.903.784, 78 basiEsone 21: 41.904.035–41.904.110, 76 basiEsone 22: 41.904.216–41.904.383, 168 basiEsone 23: 41.904.949–41.905.036, 88 basiEsone 24: 41.905.175–41.905.261, 87 basiEsone 25: 41.905.760–41.905.827, 68 basiEsone 26: 41.905.939–41.906.025, 87 basiEsone 27: 41.906.457–41.906.620, 164 basiEsone 28: 41.906.703–41.906.803, 101 basiEsone 29: 41.907.105–41.907.452, 348 basi1510152025295′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 3,2 kb dei 24,3 kb del gene; 2739 di queste basi codificano la proteina.

Sequenziamento di ARHGEF1

8Facile

Quanto è difficile sequenziare ARHGEF1 con letture corte, su 100

Quasi tutti gli esoni di ARHGEF1 si trovano in regioni in cui le letture corte si allineano in modo chiaro.

A ciò si aggiunge: la quota di esoni di ARHGEF1 in ciascun tipo di regione difficile

  • Mappabilità0%
  • Omologia0%
  • Ripetizioni3,8%
  • Contenuto GC71%
  • Copertura del riferimento0%

Un punteggio di Dante Labs basato su nostre ricerche, costruito sulle mappe delle regioni difficili da sequenziare di NIST Genome in a Bottle.Come viene calcolato

Tratti collegati a ARHGEF1

L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che ARHGEF1 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.
  • The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.

Cita questa pagina

APA

Dante Labs. (s.d.). Gene ARHGEF1: Rho guanine nucleotide exchange factor 1. Consultato il 18 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/arhgef1

Vancouver

Dante Labs. Gene ARHGEF1: Rho guanine nucleotide exchange factor 1 [Internet]. [citato il 18 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/arhgef1

Un solo test. Risposte per tutta la vita.

A partire da 449 $Spedizione gratuita · Risultati in 6–8 settimane

Ottieni il mio Genome Test