Γονίδιο
SCTR
secretin receptor
- HGNC 10608↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
- Γονίδιο Ensembl ENSG00000080293↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
- NCBI Gene 6344↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
Σύνοψη
- Κυτογενετική θέση
- 2q14.2
- Συντεταγμένες
- Χρωμόσωμα 2: 119.439.843–119.524.483 (GRCh38)
- Εξόνια
- 13 έξώνια σε 84,6 kb
- Πρωτεΐνη
- 440 αμινοξέα
- Μεταγράφημα MANE Select
- ENST00000019103.8NM_002980.3
- Τύπος locus
- Κωδικοποιητικά πρωτεΐνες
- Πολύ υψηλή
- Υψηλή
- Χαμηλή
- Πολύ χαμηλή
Αυτή η σελίδα ως δεδομένα
Προσθέστε .json στη διεύθυνση της σελίδας ή ζητήστε application/json, για να τη διαβάσετε ως JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/sctr.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameΔιαβάστε το SCTR, και το υπόλοιπο γονιδίωμά σας, με μία εξέταση.
Από 449 $Δωρεάν αποστολή · Αποτελέσματα σε 6–8 εβδομάδες
Αποκτήστε το Genome Test σαςΕπιμελημένες αναφορές που σχετίζονται με αυτό το γονίδιο
Καμία αναφορά Genome Test δεν διαβάζει ακόμα το SCTR. Η εξέταση αλληλουχεί ολόκληρο το γονιδίωμά σας, άρα τα δεδομένα σας το περιλαμβάνουν ούτως ή άλλως.
Πώς είναι διαταγμένο το SCTR
- Κωδικοποιούσα αλληλουχία
- Μη μεταφραζόμενη περιοχή
- Ιντρόνιο
- Κατεύθυνση μεταγραφής
- Περιοχές που τα σύντομα αναγνώσματα βρίσκουν δύσκολες
Εξόνια του μεταγράφηματος MANE Select του γονιδίου (έκδοση v1.5), από τα NCBI και το EMBL-EBI, στο γονιδίωμα αναφοράς GRCh38.
Ζώνες χρωμοσωμάτων από το ιδεόγραμμα GRCh38 του UCSC (2022-10-29).
Γειτονικά γονίδια από την έκδοση 116 του Ensembl, στο GRCh38.
Τα εξόνια αποτελούν 1,9 kb από τα 84,6 kb του γονιδίου· 1.323 από αυτές τις βάσεις κωδικοποιούν την πρωτεΐνη.
Αλληλούχιση SCTR
2Εύκολο
Πόσο δύσκολο είναι το SCTR να αλληλουχηθεί με σύντομες αναγνώσεις, σε κλίμακα από 0 έως 100
0 · Easy100 · Hard
Almost all of SCTR's exons sit where short reads map cleanly.
What adds to it: the share of SCTR's exons in each kind of hard region
- ΧαρτογραφησιμότηταΤμήματα όπου αναγνώσεις των 100 ή 250 bp δεν μπορούν να τοποθετηθούν μοναδικά, οπότε μια κλήση εκεί μπορεί να λείπει ή να είναι εσφαλμένη. Βάρος 35%.0%
- ΟμολογίαΤμηματικές διπλασιάσεις: αντίγραφα αλλού στο γονιδίωμα, όπως παράλογοι και ψευδογονίδια, με ταυτότητα 90% ή περισσότερο. Βάρος 30%.0%
- ΕπαναλήψειςΔιαδοχικές επαναλήψεις και σειρές από μία βάση, πάνω στις οποίες οι αναγνώσεις γλιστρούν και ενδέχεται να μην τις καλύπτουν. Βάρος 15%.0,1%
- Περιεκτικότητα σε GCΠαράθυρα με λιγότερο από 25% ή περισσότερο από 65% G και C, τα οποία η προετοιμασία της βιβλιοθήκης καλύπτει ελλιπώς. Βάρος 10%.18%
- Κάλυψη αναφοράςΚενά στη συναρμολόγηση της αναφοράς εκεί κοντά, όπου δεν υπάρχει αλληλουχία με την οποία να ευθυγραμμιστούν οι αναγνώσεις. Βάρος 10%.0%
A Dante Labs score from our own research, built on NIST's Genome in a Bottle maps of hard-to-sequence regions.How it's scoredΚάθε μπάρα είναι το μερίδιο των εξονικών βάσεων του SCTR που βρίσκονται σε αυτό το είδος δύσκολης περιοχής. Η βαθμολογία τα σταθμίζει ανάλογα με το πόσο κοστίζει το καθένα σε μια κλήση με σύντομες αναγνώσεις: 0 όταν καμία βάση δεν ανήκει σε καμία, 100 όταν κάθε βάση ανήκει σε όλες.
Εξωτερικοί σύνδεσμοι
Εγγραφές γονιδίου
Μεταγράφημα
Πρωτεΐνη
Από πού προέρχονται αυτά
- HGNC: το σύμβολο, το όνομα, τα άλλα σύμβολα και η θέση του γονιδίου.
- MANE Select v1.5, από NCBI και EMBL-EBI: το μεταγράφημα, τα εξόνιά του και η κωδικοποιούσα αλληλουχία.
- Οι στρωματοποιήσεις γονιδιώματος Genome in a Bottle, από το NIST: η βαθμολογία δυσκολίας αλληλούχισης.
Παραπομπή σε αυτή τη σελίδα
Dante Labs. (χ.η.). Γονίδιο SCTR: secretin receptor. Ανάκτηση 18 Οκτωβρίου 2026, από https://dantelabs.com/el/genes/sctr
Dante Labs. Γονίδιο SCTR: secretin receptor [Internet]. [ανακτήθηκε 18 Οκτωβρίου 2026]. Διαθέσιμο από: https://dantelabs.com/el/genes/sctr
Ένα τεστ. Απαντήσεις για όλη τη ζωή.
Από 449 $Δωρεάν αποστολή · Αποτελέσματα σε 6–8 εβδομάδες