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Gen

SPECC1

sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1

Zusammenfassung

Zytogenetische Lage
17p11.2
Koordinaten
Chromosom 17: 20.009.359–20.319.026 (GRCh38)
Exons
15 Exons über 309,7 kb
Protein
1.068 Aminosäuren
Auch bekannt als
HCMOGT-1, FLJ36955, NSP
Frühere Symbole
CYTSB
MANE-Select-Transkript
ENST00000395527.9NM_001243439.2
Locus-Typ
gene with protein product
  • Sehr hoch
  • Zuversichtlich
  • Niedrig
  • Sehr niedrig

ReferenzgenomGRCh38

Die Positionen auf den Gen- und Variantenseiten richten sich nach dieser Auswahl, in diesem Browser.

Kuratierte Berichte zu diesem Gen

Kein Genome Test-Bericht wertet SPECC1 bisher aus. Der Test sequenziert Ihr gesamtes Genom, daher sind die Daten trotzdem enthalten.

Aufbau von SPECC1

  • Kodierende Sequenz
  • Nicht translatierte Region
  • Intron
  • Transkriptionsrichtung
  • Abschnitte, die Short Reads schwer erfassen
Chromosom 17, mit einer Klammer, an der SPECC1 liegt. SPECC1 und 8 Gene in der Nähe auf Chromosom 17, von 19.664.193 bis 20.664.192.Chromosom 1717p11.2p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.319,8 Mb20 Mb20,2 Mb20,4 Mb20,6 MbALDH3A2: 19.647.291–19.685.881, Plus-StrangALDH3A2SLC47A2: 19.677.390–19.718.979, Minus-StrangSLC47A2ALDH3A1: 19.737.984–19.748.943, Minus-StrangALDH3A1ULK2: 19.770.829–19.867.965, Minus-StrangULK2AKAP10: 19.904.302–19.978.343, Minus-StrangAKAP10SPECC1: 20.009.359–20.319.026, Plus-StrangSPECC1LGALS9B: 20.449.395–20.467.548, Minus-StrangLGALS9BCDRT15L2: 20.579.724–20.580.911, Plus-StrangCDRT15L2MEIS3P2: 20.589.058–20.590.700, Plus-StrangMEIS3P2Diagramm von SPECC1: 15 Exons auf dem Plus-Strang von Chromosom 17Exon 1: 20.009.359–20.009.424, 66 BasenExon 2: 20.096.631–20.096.798, 168 BasenExon 3: 20.110.427–20.110.562, 136 BasenExon 4: 20.204.333–20.205.912, 1.580 BasenExon 5: 20.227.413–20.227.620, 208 BasenExon 6: 20.231.758–20.231.831, 74 BasenExon 7: 20.232.200–20.232.405, 206 BasenExon 8: 20.245.926–20.246.071, 146 BasenExon 9: 20.247.219–20.247.319, 101 BasenExon 10: 20.253.505–20.253.586, 82 BasenExon 11: 20.257.451–20.257.607, 157 BasenExon 12: 20.260.192–20.260.294, 103 BasenExon 13: 20.296.961–20.297.077, 117 BasenExon 14: 20.306.023–20.306.082, 60 BasenExon 15: 20.313.976–20.319.026, 5.051 Basen1510155′3′

Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.

Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).

Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.

Exons machen 8,3 kb der 309,7 kb des Gens aus; 3.207 dieser Basen kodieren für das Protein.

Woher diese Angaben stammen

  • HGNC: das Symbol des Gens, sein Name, weitere Symbole und seine Lage.
  • MANE Select v1.5, von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.

Diese Seite zitieren

APA

Dante Labs. (o. J.). SPECC1-Gen: sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1. Abgerufen am 17. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/specc1

Vancouver

Dante Labs. SPECC1-Gen: sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 [Internet]. [zitiert am 17. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/specc1

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