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Gen

SNRNP40

small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 40

Zusammenfassung

Zytogenetische Lage
1p35.2
Koordinaten
Chromosom 1: 31.259.568–31.296.788 (GRCh38)
Exons
10 Exons über 37,2 kb
Protein
357 Aminosäuren
Auch bekannt als
PRP8BP, SPF38, PRPF8BP, HPRP8BP
Frühere Symbole
WDR57
MANE-Select-Transkript
ENST00000263694.9NM_004814.3
Locus-Typ
gene with protein product
  • Sehr hoch
  • Zuversichtlich
  • Niedrig
  • Sehr niedrig

ReferenzgenomGRCh38

Die Positionen auf den Gen- und Variantenseiten richten sich nach dieser Auswahl, in diesem Browser.

Kuratierte Berichte zu diesem Gen

Kein Genome Test-Bericht wertet SNRNP40 bisher aus. Der Test sequenziert Ihr gesamtes Genom, daher sind die Daten trotzdem enthalten.

Aufbau von SNRNP40

  • Kodierende Sequenz
  • Nicht translatierte Region
  • Intron
  • Transkriptionsrichtung
  • Abschnitte, die Short Reads schwer erfassen
Chromosom 1, mit einer Klammer, an der SNRNP40 liegt. SNRNP40 und 11 Gene in der Nähe auf Chromosom 1, von 30.778.178 bis 31.778.177.Chromosom 11p35.2p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q4430,8 Mb31 Mb31,2 Mb31,4 Mb31,6 MbSDC3: 30.869.466–30.908.813, Minus-StrangSDC3PUM1: 30.931.505–31.065.991, Minus-StrangPUM1NKAIN1: 31.179.084–31.239.992, Minus-StrangNKAIN1SNRNP40: 31.259.568–31.296.788, Minus-StrangSNRNP40ZCCHC17: 31.296.942–31.371.032, Plus-StrangZCCHC17FABP3: 31.359.583–31.376.850, Minus-StrangFABP3SERINC2: 31.409.565–31.434.680, Plus-StrangSERINC2TINAGL1: 31.576.357–31.587.691, Plus-StrangTINAGL1HCRTR1: 31.617.660–31.632.518, Plus-StrangHCRTR1PEF1: 31.629.862–31.644.910, Minus-StrangPEF1COL16A1: 31.652.247–31.704.387, Minus-StrangCOL16A1ADGRB2: 31.727.117–31.764.893, Minus-StrangADGRB2Diagramm von SNRNP40: 10 Exons auf dem Minus-Strang von Chromosom 1Exon 10: 31.259.568–31.260.121, 554 BasenExon 9: 31.261.529–31.261.632, 104 BasenExon 8: 31.267.871–31.267.932, 62 BasenExon 7: 31.269.158–31.269.240, 83 BasenExon 6: 31.271.379–31.271.499, 121 BasenExon 5: 31.281.374–31.281.496, 123 BasenExon 4: 31.289.254–31.289.419, 166 BasenExon 3: 31.291.913–31.292.006, 94 BasenExon 2: 31.293.219–31.293.348, 130 BasenExon 1: 31.296.611–31.296.788, 178 Basen109876543215′3′

Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.

Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).

Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.

Exons machen 1,6 kb der 37,2 kb des Gens aus; 1.074 dieser Basen kodieren für das Protein.

Woher diese Angaben stammen

  • HGNC: das Symbol des Gens, sein Name, weitere Symbole und seine Lage.
  • MANE Select v1.5, von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.

Diese Seite zitieren

APA

Dante Labs. (o. J.). SNRNP40-Gen: small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 40. Abgerufen am 17. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/snrnp40

Vancouver

Dante Labs. SNRNP40-Gen: small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 40 [Internet]. [zitiert am 17. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/snrnp40

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