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Gen

PCDH11Y

protocadherin 11 Y-linked

Zusammenfassung

Zytogenetische Lage
Yp11.2
Koordinaten
Chromosom Y: 5.000.296–5.742.224 (GRCh38)
Exons
6 Exons über 741,9 kb
Protein
1.248 Aminosäuren
Auch bekannt als
PCDHY
Frühere Symbole
PCDH22
MANE-Select-Transkript
ENST00000698851.1NM_001395587.1
Locus-Typ
Proteinkodierend
  • Sehr hoch
  • Zuversichtlich
  • Niedrig
  • Sehr niedrig

Kuratierte Berichte zu diesem Gen

Kein Genome Test-Bericht wertet PCDH11Y bisher aus. Der Test sequenziert Ihr gesamtes Genom, daher sind die Daten trotzdem enthalten.

Aufbau von PCDH11Y

  • Kodierende Sequenz
  • Nicht translatierte Region
  • Intron
  • Transkriptionsrichtung
  • Abschnitte, die Short Reads schwer erfassen
Chromosom Y, mit einer Klammer, an der PCDH11Y liegt. PCDH11Y und 1 Gen in der Nähe auf Chromosom Y, von 4.258.367 bis 6.484.153.Chromosom YYp11.2p11.32p11.31p11.2p11.1q11.1q11.21q11.221q11.222q11.223q11.23q124,5 Mb5 Mb5,5 Mb6 MbPCDH11Y: 5.000.296–5.742.224, Plus-StrangPCDH11YTSPY2: 6.246.223–6.249.020, Plus-StrangTSPY2Diagramm von PCDH11Y: 6 Exons auf dem Plus-Strang von Chromosom YExon 1: 5.000.296–5.000.605, 310 BasenExon 2: 5.056.889–5.057.459, 571 BasenExon 3: 5.098.215–5.100.707, 2.493 BasenExon 4: 5.501.057–5.501.255, 199 BasenExon 5: 5.581.775–5.581.798, 24 BasenExon 6: 5.737.272–5.742.224, 4.953 Basen1234565′3′

Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.

Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).

Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.

Exons machen 8,6 kb der 741,9 kb des Gens aus; 3.747 dieser Basen kodieren für das Protein.

Sequenzierung von PCDH11Y

97Schwer

Wie schwer sich PCDH11Y mit Short Reads sequenzieren lässt, auf einer Skala von 100

Ein großer Teil von PCDH11Y liegt in Bereichen, in denen Short Reads eine Veränderung übersehen oder falsch zuordnen können.

Was hinzukommt: der Anteil der Exons von PCDH11Y in jeder Art schwieriger Region

  • Mappability93 %
  • Homologie100 %
  • Gemeinsam mit chrY0 %
  • Abdeckung der Referenz0 %
  • Wiederholungen4,9 %
  • GC-Gehalt12 %

Ein Score von Dante Labs aus eigener Forschung, basierend auf den Karten schwer zu sequenzierender Regionen von NIST (Genome in a Bottle).So wird bewertet

Externe Links

Herkunft der Daten

  • HGNC: das Gensymbol, der Name, weitere Symbole und die Lage des Gens.
  • MANE Select v1.5 von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.
  • Die Genome-in-a-Bottle-Genomstratifizierungen des NIST: der Schwierigkeitswert der Sequenzierung.

Diese Seite zitieren

APA

Dante Labs. (o. J.). PCDH11Y-Gen: protocadherin 11 Y-linked. Abgerufen am 20. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/pcdh11y

Vancouver

Dante Labs. PCDH11Y-Gen: protocadherin 11 Y-linked [Internet]. [zitiert am 20. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/pcdh11y

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