Gen
SCPEP1
serine carboxypeptidase 1
- HGNC 29507↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000121064↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 59342↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 17q22
- Koordinater
- Kromosom 17: 56.978.131–57.006.768 (GRCh38)
- Exoner
- 13 exoner fordelt over 28,6 kb
- Protein
- 452 aminosyrer
- Også kendt som
- RISC
- MANE Select-transkript
- ENST00000262288.8NM_021626.3
- Lokustype
- Proteinkodende
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
Denne side som data
Tilføj .json til sidens adresse, eller bed om application/json, for at læse den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/scpep1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLæs SCPEP1 og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurerede rapporter relevant for dette gen
Ingen Genome Test-rapport læser SCPEP1 endnu. Testen sekventerer hele dit genom, så dine data omfatter det alligevel.
Sådan er SCPEP1 opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 1,9 kb af genets 28,6 kb; 1.359 af disse baser koder for proteinet.
Sekventering af SCPEP1
2Lav
Hvor svært SCPEP1 er at sekventere med korte læsninger, på en skala fra 0 til 100Hver søjle viser andelen af SCPEP1s exonbaser i den pågældende type vanskeligt område. Scoren vægter dem efter, hvor meget hver enkelt koster et kald baseret på korte læsninger: 0, når ingen base ligger i nogen, og 100, når hver base ligger i alle af dem.
- MappabilitetStrækninger, hvor læsninger på 100 eller 250 bp ikke kan placeres entydigt, så et kald dér kan mangle eller være forkert. Vægt 35 %.0 %
- HomologiSegmentale duplikationer: kopier andre steder i genomet, fx paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mere. Vægt 30 %.0 %
- GentagelserTandemgentagelser og serier af én base, som læsninger glider på, og som muligvis ikke kan spændes over. Vægt 15 %.7 %
- GC-indholdVinduer med under 25 % eller over 65 % G og C, som biblioteksforberedelsen dækker dårligt. Vægt 10 %.5,5 %
- ReferencedækningHuller i referencesamlingen i nærheden, hvor der ikke findes nogen sekvens, som læsningerne kan justeres mod. Vægt 10 %.0 %
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor det kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- Genome in a Bottle-genomstratifikationerne fra NIST: sekvenseringsvanskelighedsscoren.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). SCPEP1-genet: serine carboxypeptidase 1. Hentet 18. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/scpep1
Dante Labs. SCPEP1-genet: serine carboxypeptidase 1 [Internet]. [citeret 18. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/scpep1
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger