Gen
FAM149C
family with sequence similarity 149 member C
- HGNC 25320↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000131379↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 84077↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 3p25.1
- Koordinater
- Kromosom 3: 14.675.141–14.773.036 (GRCh38)
- Exoner
- 17 exoner fordelt over 97,9 kb
- Protein
- 904 aminosyrer
- Også kendt som
- DKFZP434N1817
- Tidligere symboler
- C3orf20, FAM194C
- MANE Select-transkript
- ENST00000253697.8NM_032137.5
- Lokustype
- Proteinkodende
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
Denne side som data
Tilføj .json til sidens adresse, eller bed om application/json, for at læse den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/fam149c.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLæs FAM149C og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurerede rapporter relevant for dette gen
Ingen Genome Test-rapport læser FAM149C endnu. Testen sekventerer hele dit genom, så dine data omfatter det alligevel.
Sådan er FAM149C opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 3,3 kb af genets 97,9 kb; 2.715 af disse baser koder for proteinet.
Sekventering af FAM149C
1Let
Hvor svær FAM149C er at sekventere med korte reads, ud af 100
0 · Let100 · Svær
Næsten alle FAM149Cs exons ligger, hvor korte reads kan kortlægges tydeligt.
Det, der lægger oven i: andelen af FAM149Cs exons i hver type svær region
- KortlægbarhedStrækninger, hvor 100 eller 250 bp reads ikke kan placeres entydigt, så et kald der kan mangle eller være forkert. Vægt 35 %.0 %
- HomologiSegmentelle duplikationer: kopier andre steder i genomet, fx paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mere. Vægt 30 %.0 %
- GentagelserTandem-gentagelser og serier af én base, som reads glider på og måske ikke spænder over. Vægt 15 %.1,3 %
- GC-indholdVinduer med under 25 % eller over 65 % G og C, som biblioteksforberedelsen dækker tyndt. Vægt 10 %.8,2 %
- ReferencedækningHuller i den nærliggende referencesamling, hvor der ikke findes nogen sekvens, som reads kan alignes til. Vægt 10 %.0 %
En Dante Labs-score baseret på vores egen forskning, bygget på NIST's Genome in a Bottle-kort over svært sekventerbare regioner.Sådan scores detHver søjle er andelen af FAM149Cs exon-baser i den pågældende type svær region. Én type kan alene gøre et gen svært, og hver ekstra type tilføjer mindre: 0, når ingen base er i nogen, 100, når alle baser er der, hvor reads ikke kan placeres entydigt.
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor det kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- Genome in a Bottle-genomstratifikationerne fra NIST: sekvenseringsvanskelighedsscoren.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). FAM149C-genet: family with sequence similarity 149 member C. Hentet 18. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/fam149c
Dante Labs. FAM149C-genet: family with sequence similarity 149 member C [Internet]. [citeret 18. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/fam149c
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger