Gen
ERG
ETS transcription factor ERG
- HGNC 3446↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000157554↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 2078↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 21q22.2
- Koordinater
- Kromosom 21: 38.380.036–38.498.477 (GRCh38)
- Exoner
- 10 exoner fordelt over 118,4 kb
- Protein
- 479 aminosyrer
- Også kendt som
- erg-3, p55
- MANE Select-transkript
- ENST00000288319.12NM_182918.4
- Lokustype
- Proteinkodende
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
Denne side som data
Tilføj .json til sidens adresse, eller bed om application/json, for at læse den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/erg.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLæs ERG og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurerede rapporter relevant for dette gen
Ingen Genome Test-rapport læser ERG endnu. Testen sekventerer hele dit genom, så dine data omfatter det alligevel.
Sådan er ERG opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 4,9 kb af genets 118,4 kb; 1.440 af disse baser koder for proteinet.
Sekventering af ERG
0Let
Hvor svær ERG er at sekventere med korte reads, ud af 100
0 · Let100 · Svær
Næsten alle eksonerne i ERG ligger, hvor korte reads kan kortlægges tydeligt.
Det, der lægger til: andelen af eksonerne i ERG i hver type svær region
- KortlægningsbarhedStrækninger, hvor reads på 100 eller 250 bp ikke kan placeres entydigt, så et kald dér kan mangle eller være forkert. Vægt 35 %.0 %
- HomologiSegmentale duplikationer: kopier andre steder i genomet, fx paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mere. Vægt 30 %.0 %
- GentagelserTandem-gentagelser og serier af én base, som reads glider på og måske ikke kan spænde over. Vægt 15 %.2,5 %
- GC-indholdVinduer med under 25 % eller over 65 % G og C, som biblioteksforberedelsen dækker tyndt. Vægt 10 %.0,8 %
- ReferencedækningHuller i den nærliggende referencesamling, hvor der ikke findes nogen sekvens, som reads kan tilpasses til. Vægt 10 %.0 %
En Dante Labs-score baseret på vores egen forskning, bygget på NIST's Genome in a Bottle-kort over svært sekventerbare regioner.Sådan beregnes scorenHver søjle er andelen af eksonbaserne i ERG i den pågældende type svær region. Scoren vægter dem efter, hvor meget hver koster et kald med korte reads: 0, når ingen base ligger i nogen, 100, når alle baser ligger i alle.
Træk knyttet til ERG
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, ERG kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor det kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- Genome in a Bottle-genomstratifikationerne fra NIST: sekvenseringsvanskelighedsscoren.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). ERG-genet: ETS transcription factor ERG. Hentet 18. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/erg
Dante Labs. ERG-genet: ETS transcription factor ERG [Internet]. [citeret 18. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/erg
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger