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Gene

SOX13

SRY-box transcription factor 13

Sintesi

Localizzazione citogenetica
1q32.1
Coordinate
Cromosoma 1: 204.073.115–204.127.743 (GRCh38)
Esoni
14 esoni su 54,6 kb
Proteina
622 amminoacidi
Noto anche come
Sox-13, ICA12, MGC117216
Trascritto MANE Select
ENST00000367204.6NM_005686.3
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora SOX13. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di SOX13

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 1, con una parentesi dove si trova SOX13. SOX13 e 14 geni nelle vicinanze sul cromosoma 1, da 203.600.429 a 204.600.428.Cromosoma 11q32.1p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44203,8 Mb204 Mb204,2 Mb204,4 Mb204,6 MbATP2B4: 203.626.664–203.744.081, filamento direttoATP2B4LAX1: 203.765.169–203.778.175, filamento direttoLAX1ZC3H11A: 203.795.562–203.854.999, filamento direttoZC3H11AZBED6: 203.795.623–203.854.999, filamento direttoZBED6: 203.802.094–203.802.192, filamento direttoSNRPE: 203.861.496–203.871.152, filamento direttoSNRPESOX13: 204.073.115–204.127.743, filamento direttoSOX13ETNK2: 204.131.062–204.152.184, filamento inversoETNK2REN: 204.154.815–204.190.324, filamento inversoRENKISS1: 204.190.337–204.196.638, filamento inversoKISS1GOLT1A: 204.198.157–204.214.121, filamento inversoGOLT1APLEKHA6: 204.218.851–204.378.391, filamento inversoPLEKHA6PPP1R15B: 204.396.492–204.411.887, filamento inversoPPP1R15BPIK3C2B: 204.421.803–204.494.858, filamento inversoPIK3C2BMDM4: 204.516.369–204.558.120, filamento direttoMDM4Diagramma di SOX13: 14 esoni sul filamento diretto del cromosoma 1Esone 1: 204.073.115–204.073.711, 597 basiEsone 2: 204.112.915–204.113.134, 220 basiEsone 3: 204.114.321–204.114.432, 112 basiEsone 4: 204.114.519–204.114.605, 87 basiEsone 5: 204.116.507–204.116.679, 173 basiEsone 6: 204.117.122–204.117.190, 69 basiEsone 7: 204.117.593–204.117.707, 115 basiEsone 8: 204.121.900–204.121.985, 86 basiEsone 9: 204.122.237–204.122.399, 163 basiEsone 10: 204.122.854–204.122.963, 110 basiEsone 11: 204.123.112–204.123.208, 97 basiEsone 12: 204.123.661–204.123.804, 144 basiEsone 13: 204.124.641–204.124.857, 217 basiEsone 14: 204.125.858–204.127.743, 1886 basi1510145′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 4,1 kb dei 54,6 kb del gene; 1869 di queste basi codificano la proteina.

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.

Cita questa pagina

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Dante Labs. (s.d.). Gene SOX13: SRY-box transcription factor 13. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/sox13

Vancouver

Dante Labs. Gene SOX13: SRY-box transcription factor 13 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/sox13

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