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Gene

SLCO4C1

solute carrier organic anion transporter family member 4C1

Sintesi

Localizzazione citogenetica
5q21.1
Coordinate
Cromosoma 5: 102.233.986–102.296.284 (GRCh38)
Esoni
13 esoni su 62,3 kb
Proteina
724 amminoacidi
Noto anche come
SLC21A20, OATP4C1, OATPX, OATP-H
Trascritto MANE Select
ENST00000310954.7NM_180991.5
Tipo di locus
Protein-coding
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora SLCO4C1. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di SLCO4C1

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 5, con una parentesi dove si trova SLCO4C1. SLCO4C1 e 2 geni nelle vicinanze sul cromosoma 5, da 101.765.135 a 102.765.134.Cromosoma 55q21.1p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.3101,8 Mb102 Mb102,2 Mb102,4 Mb102,6 MbSLCO4C1: 102.233.986–102.296.284, filamento inversoSLCO4C1SLCO6A1: 102.371.774–102.499.016, filamento inversoSLCO6A1PAM: 102.753.981–103.031.149, filamento direttoPAMDiagramma di SLCO4C1: 13 esoni sul filamento inverso del cromosoma 5Esone 13: 102.233.986–102.237.018, 3033 basiEsone 12: 102.239.251–102.239.388, 138 basiEsone 11: 102.240.718–102.240.782, 65 basiEsone 10: 102.247.252–102.247.442, 191 basiEsone 9: 102.249.638–102.249.788, 151 basiEsone 8: 102.257.115–102.257.310, 196 basiEsone 7: 102.257.943–102.258.087, 145 basiEsone 6: 102.260.213–102.260.319, 107 basiEsone 5: 102.261.912–102.262.033, 122 basiEsone 4: 102.263.684–102.263.780, 97 basiEsone 3: 102.270.624–102.270.806, 183 basiEsone 2: 102.291.343–102.291.606, 264 basiEsone 1: 102.295.908–102.296.284, 377 basi131210864215′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 5,1 kb dei 62,3 kb del gene; 2175 di queste basi codificano la proteina.

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.

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Dante Labs. (s.d.). Gene SLCO4C1: solute carrier organic anion transporter family member 4C1. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/slco4c1

Vancouver

Dante Labs. Gene SLCO4C1: solute carrier organic anion transporter family member 4C1 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/slco4c1

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