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Gene

MS4A5

membrane spanning 4-domains A5

Sintesi

Localizzazione citogenetica
11q12.2
Coordinate
Cromosoma 11: 60.429.572–60.447.792 (GRCh38)
Esoni
5 esoni su 18,2 kb
Proteina
200 amminoacidi
Noto anche come
CD20L2
Trascritto MANE Select
ENST00000300190.7NM_023945.3
Tipo di locus
Codificanti per proteine
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora MS4A5. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di MS4A5

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 11, con una parentesi dove si trova MS4A5. MS4A5 e 26 geni nelle vicinanze sul cromosoma 11, da 59.938.682 a 60.938.681.Cromosoma 1111q12.2p15.5p15.4p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12p11.2p11.12p11.11q11q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q13.4q13.5q14.1q14.2q14.3q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q2560 Mb60,2 Mb60,4 Mb60,6 Mb60,8 MbOOSP1: 59.938.432–59.957.481, filamento direttoOOSP1OOSP4A: 59.963.918–59.970.357, filamento direttoOOSP4AOOSP4B: 59.978.020–60.031.095, filamento direttoOOSP4BOOSP2: 60.040.282–60.053.856, filamento direttoOOSP2MS4A3: 60.056.587–60.071.115, filamento direttoMS4A3MS4A2: 60.088.261–60.098.467, filamento direttoMS4A2MS4A6A: 60.169.930–60.184.666, filamento inversoMS4A6AMS4A4A: 60.185.657–60.318.311, filamento direttoMS4A4AMS4A4E: 60.200.270–60.243.162, filamento inversoMS4A4EMS4A6E: 60.327.251–60.396.596, filamento direttoMS4A6EMS4A7: 60.363.737–60.395.954, filamento direttoMS4A7MS4A14: 60.378.530–60.417.756, filamento direttoMS4A14MS4A5: 60.429.572–60.447.792, filamento direttoMS4A5MS4A1: 60.455.752–60.470.752, filamento direttoMS4A1MS4A12: 60.492.696–60.507.535, filamento direttoMS4A12MS4A13: 60.515.392–60.542.721, filamento direttoMS4A13MS4A8: 60.699.576–60.716.627, filamento direttoMS4A8MS4A18: 60.724.720–60.745.028, filamento direttoMS4A18MS4A15: 60.756.863–60.776.733, filamento direttoMS4A15MS4A10: 60.785.333–60.801.305, filamento direttoMS4A10CCDC86: 60.841.981–60.851.095, filamento direttoCCDC86PTGDR2: 60.850.933–60.855.987, filamento inversoPTGDR2ZP1: 60.867.542–60.875.693, filamento direttoZP1PRPF19: 60.890.547–60.906.607, filamento inversoPRPF19TMEM109: 60.912.521–60.923.443, filamento direttoTMEM109TMEM132A: 60.924.453–60.937.159, filamento direttoTMEM132ASLC15A3: 60.937.060–60.952.653, filamento inversoSLC15A3Diagramma di MS4A5: 5 esoni sul filamento diretto del cromosoma 11Esone 1: 60.429.572–60.429.827, 256 basiEsone 2: 60.430.796–60.430.924, 129 basiEsone 3: 60.432.411–60.432.467, 57 basiEsone 4: 60.433.765–60.433.917, 153 basiEsone 5: 60.447.649–60.447.792, 144 basi123455′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 0,7 kb dei 18,2 kb del gene; 603 di queste basi codificano la proteina.

Sequenziamento di MS4A5

0Bassa

Quanto è difficile sequenziare MS4A5 con letture corte, su 100

  • Mappabilità0%
  • Omologia0%
  • Ripetizioni0%
  • Contenuto di GC0%
  • Copertura di riferimento0%

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.

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Dante Labs. (s.d.). Gene MS4A5: membrane spanning 4-domains A5. Consultato il 18 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/ms4a5

Vancouver

Dante Labs. Gene MS4A5: membrane spanning 4-domains A5 [Internet]. [citato il 18 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/ms4a5

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