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Gene

LRWD1

leucine rich repeats and WD repeat domain containing 1

Sintesi

Localizzazione citogenetica
7q22.1
Coordinate
Cromosoma 7: 102.464.984–102.473.168 (GRCh38)
Esoni
15 esoni su 8,2 kb
Proteina
647 amminoacidi
Noto anche come
DKFZp434K1815, ORCA, CENP-33
Trascritto MANE Select
ENST00000292616.10NM_152892.3
Tipo di locus
Codificanti per proteine
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora LRWD1. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di LRWD1

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
Cromosoma 7, con una parentesi dove si trova LRWD1. LRWD1 e 22 geni nelle vicinanze sul cromosoma 7, da 101.969.076 a 102.969.075.Cromosoma 77q22.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q21.11q21.12q21.13q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q31.1q31.2q31.31q31.32q31.33q32.1q32.2q32.3q33q34q35q36.1q36.2q36.3102 Mb102,2 Mb102,4 Mb102,6 Mb102,8 MbCUX1: 101.815.904–102.283.958, filamento direttoCUX1SH2B2: 102.284.995–102.321.712, filamento direttoSH2B2SPDYE6: 102.345.746–102.356.444, filamento inversoSPDYE6PRKRIP1: 102.363.808–102.426.679, filamento direttoPRKRIP1ORAI2: 102.433.106–102.456.825, filamento direttoORAI2ALKBH4: 102.456.221–102.464.899, filamento inversoALKBH4LRWD1: 102.464.984–102.473.168, filamento direttoLRWD1POLR2J: 102.473.110–102.478.936, filamento inversoPOLR2JRASA4B: 102.479.976–102.517.800, filamento inversoPOLR2J3: 102.537.918–102.572.653, filamento inversoPOLR2J3UPK3BL2: 102.537.919–102.543.759, filamento inversoUPK3BL2: 102.541.501–102.592.444, filamento inversoSPDYE2: 102.551.226–102.563.538, filamento direttoSPDYE2POLR2J3: 102.552.328–102.572.620, filamento inversoPOLR2J3RASA4: 102.579.646–102.616.779, filamento inverso: 102.582.523–102.642.869, filamento inversoUPK3BL1: 102.637.024–102.642.980, filamento inversoUPK3BL1POLR2J3-UPK3BL2: 102.637.049–102.671.641, filamento inversoSPDYE2B: 102.650.319–102.662.625, filamento direttoSPDYE2BPOLR2J2: 102.665.368–102.671.752, filamento inversoFAM185A: 102.748.939–102.852.476, filamento direttoFAM185AFBXL13: 102.811.020–103.075.400, filamento inversoFBXL13LRRC17: 102.912.941–102.945.111, filamento direttoLRRC17Diagramma di LRWD1: 15 esoni sul filamento diretto del cromosoma 7Esone 1: 102.464.984–102.465.160, 177 basiEsone 2: 102.465.817–102.466.051, 235 basiEsone 3: 102.466.154–102.466.270, 117 basiEsone 4: 102.467.339–102.467.479, 141 basiEsone 5: 102.467.719–102.467.823, 105 basiEsone 6: 102.468.062–102.468.187, 126 basiEsone 7: 102.468.263–102.468.377, 115 basiEsone 8: 102.468.554–102.468.654, 101 basiEsone 9: 102.468.855–102.469.062, 208 basiEsone 10: 102.469.574–102.469.646, 73 basiEsone 11: 102.469.742–102.469.882, 141 basiEsone 12: 102.472.218–102.472.309, 92 basiEsone 13: 102.472.454–102.472.609, 156 basiEsone 14: 102.472.692–102.472.804, 113 basiEsone 15: 102.472.909–102.473.168, 260 basi1234567891011121314155′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 2,2 kb dei 8,2 kb del gene; 1944 di queste basi codificano la proteina.

Sequenziamento di LRWD1

7Bassa

Quanto è difficile sequenziare LRWD1 con letture corte, su 100

  • Mappabilità0%
  • Omologia0%
  • Ripetizioni1,9%
  • Contenuto di GC63%
  • Copertura di riferimento0%

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.

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Dante Labs. (s.d.). Gene LRWD1: leucine rich repeats and WD repeat domain containing 1. Consultato il 18 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/lrwd1

Vancouver

Dante Labs. Gene LRWD1: leucine rich repeats and WD repeat domain containing 1 [Internet]. [citato il 18 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/lrwd1

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