Variante
LDLR D90A
NM_000527.5(LDLR):c.269A>C (p.Asp90Ala)
- p.Asp90Ala
- p.D90A
- rs771019366
- Classificazione ClinVar
- Probabilmente patogena
- Stato della revisione
- 3 stelle su 4revisionata da un panel di esperti
- Ultima valutazione
- 28 agosto 2022
- Panel di esperti
- ClinGen Familial Hypercholesterolemia Variant Curation Expert Panel
Dati aggiornati alla versione 2026-10-12 di ClinVar · Versione dei dati di Dante Labs 2026.10.19-9814e911Dati modificati l'ultima volta il 18 ottobre 2026
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page$variant$nameRiepilogo
D90A è una variante missense in LDLR: modifica un singolo amminoacido nella proteina codificata dal gene. ClinVar la classifica come probabilmente patogena per hypercholesterolemia, familial, 1 (revisionata da un panel di esperti).
Classificazioni ClinVar
| Condizione | Classificazione | Stato della revisione | Invii | Ultima valutazione |
|---|---|---|---|---|
| hypercholesterolemia, familial, 1ClinVar VCV000440555 (si apre in una nuova scheda) | Probabilmente patogena | 3 stelle su 4revisionata da un panel di esperti | 1 invio | 28 agosto 2022 |
Classificazioni come registrate da ClinVar nella versione 2026-10-12. ClinVar le aggiorna man mano che le evidenze vengono esaminate.
Criteri ACMG/AMP
I criteri ACMG/AMP soddisfatti da D90A, a partire dall'effetto previsto su LDLR, da gnomAD e da ClinVar.
| Criterio | Intensità | Si basa su |
|---|---|---|
| PM2Assente o molto rara nelle banche dati di popolazione | Di supporto | Non rilevata in esomi gnomAD e genomi gnomAD |
| PP5Una fonte attendibile la riporta come patogenica | Di supporto | ClinVar: Probabilmente patogena (revisionata da un panel di esperti) |
Secondo questi criteri da soli: significato incerto.
Valutato automaticamente, senza prove funzionali, computazionali o familiari. Non è una classificazione clinica.
Frequenza nella popolazione
Quanto spesso D90A si riscontra tra le persone i cui esomi e genomi sono raccolti in gnomAD 4.1.
| Dataset | Frequenza allelica | Conteggio alleli | Omozigoti | Più comune in |
|---|---|---|---|---|
| esomi gnomAD | Non riscontrato | 0 su 0 | 0 | |
| genomi gnomAD | Non riscontrato | 0 su 0 | 0 |
Dati da gnomAD 4.1, pubblicati così come gnomAD li fornisce. I gruppi sono gruppi di ascendenza genetica così come gnomAD li inferisce. Descrivono la variante nelle popolazioni di gnomAD, non il risultato di nessuna persona.
Dove si trova in LDLR
D90A si trova nell'esone 3 dei 18 della trascrizione MANE Select di LDLR, NM_000527.5.
Dettagli molecolari
| Gene | LDLR |
|---|---|
| Trascritto | NM_000527.5MANE Select |
| Variazione del DNA codificante (HGVS c.) | c.269A>C |
| Variazione proteica (HGVS p.) | p.Asp90Alap.D90A |
| Conseguenza prevista | Missensomissense_variant (si apre in una nuova scheda) |
| Impatto previsto | Moderato |
| Posizione (GRCh38) | chr19:11102742 A>C |
| Posizione (GRCh37) | chr19:11213418 A>C |
| ID dbSNP | rs771019366 (si apre in una nuova scheda) |
| ID di variazione ClinVar | VCV000440555 (si apre in una nuova scheda) |
| ID allele ClinVar | 434205 |
| ID di ClinGen Allele Registry | CA404075695 (si apre in una nuova scheda) |
| Nome in ClinVar | NM_000527.5(LDLR):c.269A>C (p.Asp90Ala) |
LDLR D90A in altri database
Report che analizzano questa variante (2)
Questi report sulle condizioni di Genome Test includono D90A tra le varianti analizzate.
| Report | Condizioni | Ereditarietà |
|---|---|---|
| Familial Hypercholesterolemia | familial hypercholesterolemia | |
| Hyperlipidemia | Hyperlipidemia |
Altre varianti in LDLR
- A399DProbabilmente patogena3 stelle su 4
- A399TProbabilmente patogena3 stelle su 4
- A431PProbabilmente patogena3 stelle su 4
- A431TPatogena3 stelle su 4
- A540SProbabilmente patogena3 stelle su 4
- A540TPatogena3 stelle su 4
- A612Rfs*50Probabilmente patogena3 stelle su 4
- A697PProbabilmente patogena3 stelle su 4
- c.1A>CPatogena3 stelle su 4
- c.1A>GProbabilmente patogena3 stelle su 4
Limitazioni
Questa pagina descrive informazioni pubblicamente disponibili su una variante genetica. Non costituisce una diagnosi e non dice nulla sul fatto che Lei o altre persone portino questa variante.
Le classificazioni provengono da ClinVar e cambiano man mano che vengono esaminate nuove evidenze. Una classificazione riportata qui può differire da quella attuale in ClinVar o da quella indicata da un laboratorio.
Il sequenziamento dell'intero genoma con letture corte può non rilevare o interpretare erroneamente alcune varianti, in particolare in tratti di DNA ripetuti o molto simili tra loro e in inserzioni, delezioni o riarrangiamenti di grandi dimensioni.
Se ha domande su una variante presente nei Suoi risultati o in quelli della Sua famiglia, si rivolga a un consulente genetico o al proprio medico.
Fonti e crediti
- Classificazioni da ClinVar (versione 2026-10-12), National Center for Biotechnology Information.
- Termini delle condizioni dal Mondo Disease Ontology (versione 2026-10-06), utilizzati secondo la licenza CC BY 4.0.
- Simboli e nomi dei geni dell'HUGO Gene Nomenclature Committee (versione 2026-10-16).
- Identificatori degli alleli dal ClinGen Allele Registry (versione 2026-10-19-c4908f54).
- Identificatori SNP di riferimento da dbSNP (versione b157), National Center for Biotechnology Information.
- Collegamenti gene-malattia dal Gene Curation Coalition, GenCC (versione 2026-10-19).
- Regioni difficili dal Genome in a Bottle Consortium (versione v3.6).
- Trascritti da MANE (versione v1.5), NCBI ed EMBL-EBI.
- Conseguenze previste da mehari (versione 0.11.0), con modelli di trascritti da cdot.
- Costruito dalla release dei dati Dante Labs 2026.10.19-9814e911 del 19 ottobre 2026.
Citi questa pagina
Dante Labs. (18 ottobre 2026). LDLR D90A (c.269A>C, rs771019366) (Versione 2026.10.19-9814e911). Recuperato il 20 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/genes/ldlr/variants/d90a
Dante Labs. LDLR D90A (c.269A>C, rs771019366) [Internet]. Versione 2026.10.19-9814e911. 18 ottobre 2026 [consultato il 20 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/genes/ldlr/variants/d90a
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