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Gene

LAMTOR5

late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 5

Sintesi

Localizzazione citogenetica
1p13.3
Coordinate
Cromosoma 1: 110.401.253–110.407.694 (GRCh38)
Esoni
4 esoni su 6,4 kb
Proteina
91 amminoacidi
Noto anche come
XIP, MGC71071
Simboli precedenti
HBXIP
Trascritto MANE Select
ENST00000602318.6NM_001382293.1
Tipo di locus
Codificanti per proteine
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora LAMTOR5. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di LAMTOR5

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 1, con una parentesi dove si trova LAMTOR5. LAMTOR5 e 14 geni nelle vicinanze sul cromosoma 1, da 109.904.474 a 110.904.473.Cromosoma 11p13.3p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44110 Mb110,2 Mb110,4 Mb110,6 Mb110,8 MbCSF1: 109.910.242–109.930.993, filamento direttoCSF1AHCYL1: 109.984.721–110.023.742, filamento direttoAHCYL1STRIP1: 110.031.577–110.074.641, filamento direttoSTRIP1ALX3: 110.059.870–110.070.677, filamento inversoALX3UBL4B: 110.112.443–110.113.947, filamento direttoUBL4BSLC6A17: 110.150.482–110.202.202, filamento direttoSLC6A17KCNC4: 110.210.095–110.283.100, filamento direttoKCNC4RBM15: 110.338.506–110.346.681, filamento direttoRBM15SLC16A4: 110.362.847–110.391.082, filamento inversoSLC16A4LAMTOR5: 110.401.253–110.407.694, filamento inversoLAMTOR5PROK1: 110.451.058–110.457.358, filamento direttoPROK1KCNA10: 110.517.217–110.519.175, filamento inversoKCNA10KCNA2: 110.519.837–110.631.474, filamento inversoKCNA2KCNA3: 110.653.560–110.674.940, filamento inversoKCNA3CD53: 110.871.170–110.899.936, filamento direttoCD53Diagramma di LAMTOR5: 4 esoni sul filamento inverso del cromosoma 1Esone 4: 110.401.253–110.401.583, 331 basiEsone 3: 110.403.919–110.404.036, 118 basiEsone 2: 110.406.318–110.406.379, 62 basiEsone 1: 110.407.586–110.407.694, 109 basi43215′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 0,6 kb dei 6,4 kb del gene; 276 di queste basi codificano la proteina.

Sequenziamento di LAMTOR5

2Bassa

Quanto è difficile sequenziare LAMTOR5 con letture corte, su 100

  • Mappabilità0%
  • Omologia0%
  • Ripetizioni0%
  • Contenuto di GC18%
  • Copertura di riferimento0%

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gene LAMTOR5: late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 5. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/lamtor5

Vancouver

Dante Labs. Gene LAMTOR5: late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 5 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/lamtor5

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