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Gene

EPHB1

EPH receptor B1

Sintesi

Localizzazione citogenetica
3q22.2
Coordinate
Cromosoma 3: 134.795.260–135.260.467 (GRCh38)
Esoni
16 esoni su 465,2 kb
Proteina
984 amminoacidi
Noto anche come
Hek6
Simboli precedenti
EPHT2
Trascritto MANE Select
ENST00000398015.8NM_004441.5
Tipo di locus
Codificanti per proteine
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora EPHB1. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di EPHB1

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 3, con una parentesi dove si trova EPHB1. EPHB1 e 4 geni nelle vicinanze sul cromosoma 3, da 134.330.052 a 135.725.675.Cromosoma 33q22.2p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q29134,4 Mb134,6 Mb134,8 Mb135 Mb135,2 Mb135,4 Mb135,6 MbAMOTL2: 134.355.347–134.375.479, filamento inversoAMOTL2ANAPC13: 134.476.251–134.486.716, filamento inversoANAPC13CEP63: 134.485.699–134.587.789, filamento direttoCEP63KY: 134.599.923–134.651.677, filamento inversoKYEPHB1: 134.795.260–135.260.467, filamento direttoEPHB1Diagramma di EPHB1: 16 esoni sul filamento diretto del cromosoma 3Esone 1: 134.795.260–134.795.689, 430 basiEsone 2: 134.925.816–134.925.880, 65 basiEsone 3: 134.951.371–134.952.052, 682 basiEsone 4: 135.106.448–135.106.603, 156 basiEsone 5: 135.132.714–135.133.049, 336 basiEsone 6: 135.154.152–135.154.276, 125 basiEsone 7: 135.162.018–135.162.180, 163 basiEsone 8: 135.165.968–135.166.076, 109 basiEsone 9: 135.166.942–135.167.006, 65 basiEsone 10: 135.179.860–135.179.982, 123 basiEsone 11: 135.192.576–135.192.823, 248 basiEsone 12: 135.201.474–135.201.689, 216 basiEsone 13: 135.241.148–135.241.297, 150 basiEsone 14: 135.248.316–135.248.509, 194 basiEsone 15: 135.249.336–135.249.491, 156 basiEsone 16: 135.259.012–135.260.467, 1456 basi12468101214165′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 4,7 kb dei 465,2 kb del gene; 2955 di queste basi codificano la proteina.

Sequenziamento EPHB1

2Facile

Quanto è difficile sequenziare EPHB1 con letture corte, su 100

Quasi tutti gli esoni di EPHB1 si trovano in punti in cui le letture corte si allineano in modo chiaro.

Cosa aggrava il quadro: la quota degli esoni di EPHB1 in ciascun tipo di regione difficile

  • Mappabilità0%
  • Omologia0%
  • Ripetizioni4,6%
  • Contenuto GC11%
  • Copertura del riferimento0%

Un punteggio Dante Labs basato su nostre ricerche, costruito sulle mappe delle regioni difficili da sequenziare Genome in a Bottle del NIST.Come viene calcolato il punteggio

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.

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Dante Labs. (s.d.). Gene EPHB1: EPH receptor B1. Consultato il 18 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/ephb1

Vancouver

Dante Labs. Gene EPHB1: EPH receptor B1 [Internet]. [citato il 18 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/ephb1

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