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Gene

COL6A5

collagen type VI alpha 5 chain

Sintesi

Localizzazione citogenetica
3q22.1
Coordinate
Cromosoma 3: 130.345.672–130.484.846 (GRCh38)
Esoni
41 esoni su 139,2 kb
Proteina
2614 amminoacidi
Noto anche come
FLJ35880, VWA4
Simboli precedenti
COL29A1
Trascritto MANE Select
ENST00000373157.9NM_001278298.2
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora COL6A5. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di COL6A5

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 3, con una parentesi dove si trova COL6A5. COL6A5 e 5 geni nelle vicinanze sul cromosoma 3, da 129.915.259 a 130.915.258.Cromosoma 33q22.1p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q29130 Mb130,2 Mb130,4 Mb130,6 Mb130,8 MbTRH: 129.974.293–129.977.940, filamento direttoTRHALG1L2: 130.081.831–130.113.227, filamento direttoALG1L2COL6A5: 130.345.672–130.484.846, filamento direttoCOL6A5COL6A6: 130.517.171–130.677.044, filamento direttoCOL6A6PIK3R4: 130.678.923–130.746.857, filamento inversoPIK3R4ATP2C1: 130.850.504–131.016.759, filamento direttoATP2C1Diagramma di COL6A5: 41 esoni sul filamento diretto del cromosoma 3Esone 1: 130.345.672–130.345.981, 310 basiEsone 2: 130.373.611–130.373.705, 95 basiEsone 3: 130.376.237–130.376.836, 600 basiEsone 4: 130.379.418–130.380.050, 633 basiEsone 5: 130.384.804–130.385.364, 561 basiEsone 6: 130.388.580–130.389.134, 555 basiEsone 7: 130.391.179–130.391.754, 576 basiEsone 8: 130.394.890–130.395.465, 576 basiEsone 9: 130.397.583–130.397.923, 341 basiEsone 10: 130.398.030–130.398.111, 82 basiEsone 11: 130.401.031–130.401.173, 143 basiEsone 12: 130.401.762–130.401.854, 93 basiEsone 13: 130.403.609–130.403.662, 54 basiEsone 14: 130.405.588–130.405.659, 72 basiEsone 15: 130.405.993–130.406.019, 27 basiEsone 16: 130.406.131–130.406.175, 45 basiEsone 17: 130.406.268–130.406.321, 54 basiEsone 18: 130.409.326–130.409.388, 63 basiEsone 19: 130.410.009–130.410.074, 66 basiEsone 20: 130.410.471–130.410.524, 54 basiEsone 21: 130.413.545–130.413.580, 36 basiEsone 22: 130.414.069–130.414.131, 63 basiEsone 23: 130.415.645–130.415.707, 63 basiEsone 24: 130.416.757–130.416.819, 63 basiEsone 25: 130.418.869–130.418.931, 63 basiEsone 26: 130.421.153–130.421.203, 51 basiEsone 27: 130.421.325–130.421.360, 36 basiEsone 28: 130.422.720–130.422.782, 63 basiEsone 29: 130.423.838–130.423.900, 63 basiEsone 30: 130.426.214–130.426.249, 36 basiEsone 31: 130.426.367–130.426.403, 37 basiEsone 32: 130.429.573–130.429.584, 12 basiEsone 33: 130.431.465–130.431.949, 485 basiEsone 34: 130.439.522–130.439.615, 94 basiEsone 35: 130.440.166–130.440.825, 660 basiEsone 36: 130.443.476–130.443.566, 91 basiEsone 37: 130.455.455–130.455.666, 212 basiEsone 38: 130.468.795–130.469.481, 687 basiEsone 39: 130.470.871–130.470.967, 97 basiEsone 40: 130.471.682–130.471.926, 245 basiEsone 41: 130.484.035–130.484.846, 812 basi1510152025303540415′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 9 kb dei 139,2 kb del gene; 7845 di queste basi codificano la proteina.

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.

Cita questa pagina

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Dante Labs. (s.d.). Gene COL6A5: collagen type VI alpha 5 chain. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/col6a5

Vancouver

Dante Labs. Gene COL6A5: collagen type VI alpha 5 chain [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/col6a5

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