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Gene

CIMIP5

ciliary microtubule inner protein 5

Sintesi

Localizzazione citogenetica
2p25.1
Coordinate
Cromosoma 2: 11.133.128–11.151.317 (GRCh38)
Esoni
3 esoni su 18,2 kb
Proteina
162 amminoacidi
Noto anche come
FLJ25143
Simboli precedenti
C2orf50
Trascritto MANE Select
ENST00000381585.8NM_001371321.1
Tipo di locus
Codificanti per proteine
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora CIMIP5. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di CIMIP5

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 2, con una parentesi dove si trova CIMIP5. CIMIP5 e 8 geni nelle vicinanze sul cromosoma 2, da 10.642.223 a 11.642.222.Cromosoma 22p25.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23.3p23.2p23.1p22.3p22.2p22.1p21p16.3p16.2p16.1p15p14p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13q14.1q14.2q14.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q34q35q36.1q36.2q36.3q37.1q37.2q37.310,8 Mb11 Mb11,2 Mb11,4 Mb11,6 MbNOL10: 10.562.295–10.690.415, filamento inversoNOL10ATP6V1C2: 10.721.100–10.785.710, filamento direttoATP6V1C2PDIA6: 10.781.710–10.837.977, filamento inversoPDIA6KCNF1: 10.911.096–10.914.225, filamento direttoKCNF1CIMIP5: 11.133.128–11.151.317, filamento direttoCIMIP5SLC66A3: 11.155.198–11.178.870, filamento direttoSLC66A3ROCK2: 11.179.759–11.348.330, filamento inversoROCK2E2F6: 11.444.375–11.466.177, filamento inversoE2F6GREB1: 11.482.341–11.642.789, filamento direttoGREB1Diagramma di CIMIP5: 3 esoni sul filamento diretto del cromosoma 2Esone 1: 11.133.128–11.133.591, 464 basiEsone 2: 11.140.510–11.140.549, 40 basiEsone 3: 11.143.920–11.151.317, 7398 basi1235′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 7,9 kb dei 18,2 kb del gene; 489 di queste basi codificano la proteina.

Sequenziamento di CIMIP5

1Facile

Quanto è difficile sequenziare CIMIP5 con letture corte, su 100

Quasi tutti gli esoni di CIMIP5 si trovano in regioni in cui le letture corte si allineano in modo chiaro.

A ciò si aggiunge: la quota di esoni di CIMIP5 in ciascun tipo di regione difficile

  • Mappabilità0%
  • Omologia0%
  • Ripetizioni4,6%
  • Contenuto GC5,8%
  • Copertura del riferimento0%

Un punteggio di Dante Labs basato su nostre ricerche, costruito sulle mappe delle regioni difficili da sequenziare di NIST Genome in a Bottle.Come viene calcolato

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.

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Dante Labs. (s.d.). Gene CIMIP5: ciliary microtubule inner protein 5. Consultato il 18 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/cimip5

Vancouver

Dante Labs. Gene CIMIP5: ciliary microtubule inner protein 5 [Internet]. [citato il 18 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/cimip5

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