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Gene

CCNL1

cyclin L1

Sintesi

Localizzazione citogenetica
3q25.31
Coordinate
Cromosoma 3: 157.147.553–157.160.147 (GRCh38)
Esoni
11 esoni su 12,6 kb
Proteina
526 amminoacidi
Noto anche come
ania-6a
Trascritto MANE Select
ENST00000295926.8NM_020307.4
Tipo di locus
Codificanti per proteine
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora CCNL1. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di CCNL1

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
Cromosoma 3, con una parentesi dove si trova CCNL1. CCNL1 e 4 geni nelle vicinanze sul cromosoma 3, da 156.653.850 a 157.653.849.Cromosoma 33q25.31p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q29156,8 Mb157 Mb157,2 Mb157,4 Mb157,6 MbTIPARP: 156.673.235–156.706.770, filamento direttoTIPARPLEKR1: 156.825.481–157.046.129, filamento direttoLEKR1CCNL1: 157.147.553–157.160.147, filamento inversoCCNL1VEPH1: 157.259.742–157.533.619, filamento inversoVEPH1PTX3: 157.436.843–157.443.633, filamento direttoPTX3Diagramma di CCNL1: 11 esoni sul filamento inverso del cromosoma 3Esone 11: 157.147.553–157.148.589, 1037 basiEsone 10: 157.149.287–157.149.385, 99 basiEsone 9: 157.149.485–157.149.596, 112 basiEsone 8: 157.149.836–157.149.977, 142 basiEsone 7: 157.150.065–157.150.169, 105 basiEsone 6: 157.150.282–157.150.381, 100 basiEsone 5: 157.152.177–157.152.241, 65 basiEsone 4: 157.153.036–157.153.156, 121 basiEsone 3: 157.158.866–157.158.975, 110 basiEsone 2: 157.159.405–157.159.479, 75 basiEsone 1: 157.159.792–157.160.147, 356 basi1110864215′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 2,3 kb dei 12,6 kb del gene; 1581 di queste basi codificano la proteina.

Sequenziamento di CCNL1

2Facile

Quanto è difficile sequenziare CCNL1 con letture corte, su 100

Quasi tutti gli esoni di CCNL1 si trovano in regioni in cui le letture corte si allineano in modo chiaro.

A ciò si aggiunge: la quota di esoni di CCNL1 in ciascun tipo di regione difficile

  • Mappabilità0%
  • Omologia0%
  • Ripetizioni3,3%
  • Contenuto GC15%
  • Copertura del riferimento0%

Un punteggio di Dante Labs basato su nostre ricerche, costruito sulle mappe delle regioni difficili da sequenziare di NIST Genome in a Bottle.Come viene calcolato

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.

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Dante Labs. (s.d.). Gene CCNL1: cyclin L1. Consultato il 18 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/ccnl1

Vancouver

Dante Labs. Gene CCNL1: cyclin L1 [Internet]. [citato il 18 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/ccnl1

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