Gen
SMR3A
submaxillary gland androgen regulated protein 3A
- HGNC 19216↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000109208↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 26952↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 4q13.3
- Koordinater
- Kromosom 4: 70.360.760–70.367.158 (GRCh38)
- Exoner
- 3 exoner fordelt over 6,4 kb
- Protein
- 134 aminosyrer
- Også kendt som
- PBI, PRL5
- Tidligere symboler
- PROL5
- MANE Select-transkript
- ENST00000226460.5NM_012390.4
- Lokustype
- Proteinkodende
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
Denne side som data
Tilføj .json til sidens adresse, eller bed om application/json, for at læse den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/smr3a.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLæs SMR3A og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurerede rapporter relevant for dette gen
Ingen Genome Test-rapport læser SMR3A endnu. Testen sekventerer hele dit genom, så dine data omfatter det alligevel.
Sådan er SMR3A opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 0,7 kb af genets 6,4 kb; 405 af disse baser koder for proteinet.
Sekventering af SMR3A
15Moderat
Hvor svær SMR3A er at sekventere med korte reads, ud af 100
0 · Let100 · Svær
Nogle af SMR3As exons ligger, hvor korte reads kan overse eller fejlplacere en ændring.
Det, der lægger oven i: andelen af SMR3As exons i hver type svær region
- KortlægbarhedStrækninger, hvor 100 eller 250 bp reads ikke kan placeres entydigt, så et kald der kan mangle eller være forkert. Vægt 100 %.10 %
- HomologiSegmentelle duplikationer: kopier andre steder i genomet, fx paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mere. Vægt 60 %.0 %
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Vægt 60 %.0 %
- ReferencedækningHuller i den nærliggende referencesamling, hvor der ikke findes nogen sekvens, som reads kan alignes til. Vægt 50 %.0 %
- GentagelserTandem-gentagelser og serier af én base, som reads glider på og måske ikke spænder over. Vægt 30 %.20 %
- GC-indholdVinduer med under 25 % eller over 65 % G og C, som biblioteksforberedelsen dækker tyndt. Vægt 20 %.0 %
En Dante Labs-score baseret på vores egen forskning, bygget på NIST's Genome in a Bottle-kort over svært sekventerbare regioner.Sådan scores detHver søjle er andelen af SMR3As exon-baser i den pågældende type svær region. Én type kan alene gøre et gen svært, og hver ekstra type tilføjer mindre: 0, når ingen base er i nogen, 100, når alle baser er der, hvor reads ikke kan placeres entydigt.
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor det kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- Genome in a Bottle-genomstratifikationerne fra NIST: sekvenseringsvanskelighedsscoren.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). SMR3A-genet: submaxillary gland androgen regulated protein 3A. Hentet 19. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/smr3a
Dante Labs. SMR3A-genet: submaxillary gland androgen regulated protein 3A [Internet]. [citeret 19. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/smr3a
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger