Gen
NKX2-3
NK2 homeobox 3
- HGNC 7836↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000119919↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 159296↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 10q24.2
- Koordinater
- Kromosom 10: 99.532.942–99.536.524 (GRCh38)
- Exoner
- 2 exoner fordelt over 3,6 kb
- Protein
- 364 aminosyrer
- Også kendt som
- NKX2.3, CSX3, NKX4-3
- Tidligere symboler
- NKX2C
- MANE Select-transkript
- ENST00000344586.9NM_145285.3
- Lokustype
- Proteinkodende
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
Denne side som data
Tilføj .json til sidens adresse, eller bed om application/json, for at læse den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/nkx2-3.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLæs NKX2-3 og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurerede rapporter relevant for dette gen
Ingen Genome Test-rapport læser NKX2-3 endnu. Testen sekventerer hele dit genom, så dine data omfatter det alligevel.
Sådan er NKX2-3 opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 2,1 kb af genets 3,6 kb; 1.095 af disse baser koder for proteinet.
Sekventering af NKX2-3
14Let
Hvor svær NKX2-3 er at sekventere med korte reads, ud af 100
0 · Let100 · Svær
Næsten alle NKX2-3s exons ligger, hvor korte reads kan kortlægges tydeligt.
Det, der lægger oven i: andelen af NKX2-3s exons i hver type svær region
- KortlægbarhedStrækninger, hvor 100 eller 250 bp reads ikke kan placeres entydigt, så et kald der kan mangle eller være forkert. Vægt 100 %.0 %
- HomologiSegmentelle duplikationer: kopier andre steder i genomet, fx paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mere. Vægt 60 %.0 %
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Vægt 60 %.0 %
- ReferencedækningHuller i den nærliggende referencesamling, hvor der ikke findes nogen sekvens, som reads kan alignes til. Vægt 50 %.0 %
- GentagelserTandem-gentagelser og serier af én base, som reads glider på og måske ikke spænder over. Vægt 30 %.12 %
- GC-indholdVinduer med under 25 % eller over 65 % G og C, som biblioteksforberedelsen dækker tyndt. Vægt 20 %.52 %
En Dante Labs-score baseret på vores egen forskning, bygget på NIST's Genome in a Bottle-kort over svært sekventerbare regioner.Sådan scores detHver søjle er andelen af NKX2-3s exon-baser i den pågældende type svær region. Én type kan alene gøre et gen svært, og hver ekstra type tilføjer mindre: 0, når ingen base er i nogen, 100, når alle baser er der, hvor reads ikke kan placeres entydigt.
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor det kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- Genome in a Bottle-genomstratifikationerne fra NIST: sekvenseringsvanskelighedsscoren.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). NKX2-3-genet: NK2 homeobox 3. Hentet 19. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/nkx2-3
Dante Labs. NKX2-3-genet: NK2 homeobox 3 [Internet]. [citeret 19. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/nkx2-3
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger