Variant
MSH2 L93F
NM_000251.3(MSH2):c.277C>T (p.Leu93Phe)
- p.Leu93Phe
- p.L93F
- rs63751429
- ClinVar-klassifikation
- Sandsynligvis patogen
- Gennemgangsstatus
- 3 stjerner ud af 4Gennemgået af ekspertpanel
- Senest vurderet
- 21. juni 2019
- Ekspertpanel
- International Society for Gastrointestinal Hereditary Tumours (InSiGHT)
Data opdateret til ClinVar-udgave 2026-10-12 · Dante Labs-dataudgave 2026.10.16-c6eea6bfFakta sidst ændret 16. oktober 2026
ReferencegenomGRCh38hg38
Positioner på gen- og variantsider følger dette valg i denne browser.
Resumé
L93F er en missense-variant i MSH2: Den ændrer en enkelt aminosyre i proteinet, som genet koder for. ClinVar klassificerer den som sandsynligvis patogen for Lynch Syndrome (Gennemgået af ekspertpanel).
ClinVar-klassifikationer
| Tilstand | Klassifikation | Gennemgangsstatus | Indsendelser | Senest vurderet |
|---|---|---|---|---|
| Lynch SyndromeClinVar VCV000091044 (åbnes i en ny fane) | Sandsynligvis patogen | 3 stjerner ud af 4Gennemgået af ekspertpanel | 1 indsendelse | 21. juni 2019 |
Klassifikationer, som ClinVar registrerer dem i udgave 2026-10-12. ClinVar opdaterer dem, efterhånden som dokumentationen gennemgås.
Hvor den ligger i MSH2
L93F ligger i exon 2 af de 16 i MSH2s MANE Select-transkript, NM_000251.3.
Molekylære detaljer
| Gen | MSH2 |
|---|---|
| Transkript | NM_000251.3MANE Select |
| Ændring i kodende DNA (HGVS c.) | c.277C>T |
| Proteinændring (HGVS p.) | p.Leu93Phep.L93F |
| Forventet konsekvens | Missensemissense_variant (åbnes i en ny fane) |
| Forventet påvirkning | Moderat |
| Position (GRCh38) | chr2:47408466 C>T |
| Position (GRCh37) | chr2:47635605 C>T |
| dbSNP-ID | rs63751429 (åbnes i en ny fane) |
| ClinVar-variations-ID | VCV000091044 (åbnes i en ny fane) |
| ClinVar-allel-ID | 96519 |
| ClinGen Allele Registry-ID | CA020925 (åbnes i en ny fane) |
| ClinVar-navn | NM_000251.3(MSH2):c.277C>T (p.Leu93Phe) |
MSH2 L93F i andre databaser
Rapporter, der ser på denne variant (1)
Disse Genome Test-tilstandsrapporter omfatter L93F blandt de varianter, de ser på.
| Rapport | Tilstande | Arvelighed |
|---|---|---|
| Lynch Syndrome | Lynch Syndrome | Autosomal dominant |
Andre varianter i MSH2
- A123Vfs*51Patogen3 stjerner ud af 4
- A230Lfs*16Patogen3 stjerner ud af 4
- A230Sfs*2Patogen3 stjerner ud af 4
- A266Qfs*8Patogen3 stjerner ud af 4
- A370Qfs*3Patogen3 stjerner ud af 4
- A398Gfs*19Patogen3 stjerner ud af 4
- A499Cfs*14Patogen3 stjerner ud af 4
- A500Pfs*26Patogen3 stjerner ud af 4
- A573Pfs*17Patogen3 stjerner ud af 4
- A636PPatogen3 stjerner ud af 4
Begrænsninger
Denne side beskriver offentligt tilgængelige oplysninger om en genetisk variant. Den er ikke en diagnose, og den siger intet om, hvorvidt du eller andre bærer denne variant.
Klassificeringer stammer fra ClinVar og ændrer sig, når ny evidens gennemgås. En klassificering her kan afvige fra den, der står i ClinVar i dag, eller fra den, et laboratorium angiver.
Helgenomsekventering med korte læsninger kan overse eller fejlkalde nogle varianter, især i gentagne eller meget ens DNA-sekvenser og i store indsættelser, deletioner eller omlejringer.
Hvis du har spørgsmål om en variant i dine egne resultater eller i din familie, så tal med en genetisk rådgiver eller din læge.
Kilder og kreditering
- Klassificeringer fra ClinVar (udgivelse 2026-10-12), National Center for Biotechnology Information.
- Sygdomstermer fra Mondo Disease Ontology (udgivelse 2026-10-06), anvendt under CC BY 4.0.
- Gensymboler og -navne fra HUGO Gene Nomenclature Committee (udgivelse 2026-10-16).
- Allel-identifikatorer fra ClinGen Allele Registry (udgivelse 2026-10-16-c4908f54).
- Reference-SNP-identifikatorer fra dbSNP (udgivelse b157), National Center for Biotechnology Information.
- Gen–sygdom-forbindelser fra Gene Curation Coalition, GenCC (udgivelse 2026-10-16).
- Vanskelige regioner fra Genome in a Bottle Consortium (udgivelse v3.6).
- Transkripter fra MANE (udgivelse v1.5), NCBI og EMBL-EBI.
- Forudsagte konsekvenser fra mehari (udgivelse 0.11.0), med transkriptmodeller fra cdot.
- Bygget på Dante Labs datafrigivelse 2026.10.16-c6eea6bf af 16. oktober 2026.
Citer denne side
Dante Labs. (16. oktober 2026). MSH2 L93F (c.277C>T, rs63751429) (version 2026.10.16-c6eea6bf). Hentet 16. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/genes/msh2/variants/l93f
Dante Labs. MSH2 L93F (c.277C>T, rs63751429) [Internet]. Version 2026.10.16-c6eea6bf. 16. oktober 2026 [hentet 16. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/genes/msh2/variants/l93f
Læs dit fulde genom
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger