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Gene

SPANXD

SPANX family member D

Sintesi

Localizzazione citogenetica
Xq27.2
Coordinate
Cromosoma X: 141.697.411–141.698.739 (GRCh38)
Esoni
2 esoni su 1,3 kb
Proteina
97 amminoacidi
Noto anche come
CT11.4
Simboli precedenti
SPANXE
Trascritto MANE Select
ENST00000370515.3NM_032417.4
Tipo di locus
Codificanti per proteine
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora SPANXD. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di SPANXD

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma X, con una parentesi dove si trova SPANXD. SPANXD e 5 geni nelle vicinanze sul cromosoma X, da 141.198.075 a 142.198.074.Cromosoma XXq27.2p22.33p22.32p22.31p22.2p22.13p22.12p22.11p21.3p21.2p21.1p11.4p11.3p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26.1q26.2q26.3q27.1q27.2q27.3q28141,2 Mb141,4 Mb141,6 Mb141,8 Mb142 MbSPANXC: 141.241.463–141.242.517, filamento inversoSPANXCSPANXA1: 141.583.674–141.584.738, filamento inversoSPANXA1SPANXA2: 141.589.708–141.590.762, filamento direttoSPANXA2SPANXD: 141.697.411–141.698.739, filamento inversoSPANXDMAGEC3: 141.838.316–141.898.234, filamento direttoMAGEC3MAGEC1: 141.903.863–141.917.770, filamento direttoMAGEC1Diagramma di SPANXD: 2 esoni sul filamento inverso del cromosoma XEsone 2: 141.697.411–141.697.686, 276 basiEsone 1: 141.698.334–141.698.739, 406 basi215′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 0,7 kb dei 1,3 kb del gene; 294 di queste basi codificano la proteina.

Sequenziamento di SPANXD

65Difficile

Quanto è difficile sequenziare SPANXD con letture corte, su 100

Gran parte di SPANXD si trova in regioni in cui le letture corte possono non rilevare o posizionare erroneamente una variazione.

A ciò si aggiunge: la quota di esoni di SPANXD in ciascun tipo di regione difficile

  • Mappabilità100%
  • Omologia100%
  • Ripetizioni0%
  • Contenuto GC0%
  • Copertura del riferimento0%

Un punteggio di Dante Labs basato su nostre ricerche, costruito sulle mappe delle regioni difficili da sequenziare di NIST Genome in a Bottle.Come viene calcolato

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.

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Dante Labs. (s.d.). Gene SPANXD: SPANX family member D. Consultato il 19 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/spanxd

Vancouver

Dante Labs. Gene SPANXD: SPANX family member D [Internet]. [citato il 19 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/spanxd

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