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Gene

SNX27

sorting nexin 27

Sintesi

Localizzazione citogenetica
1q21.3
Coordinate
Cromosoma 1: 151.612.050–151.699.080 (GRCh38)
Esoni
12 esoni su 87 kb
Proteina
541 amminoacidi
Noto anche come
MY014, KIAA0488, MGC20471
Trascritto MANE Select
ENST00000458013.7NM_001330723.2
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Genoma di riferimentoGRCh38

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Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora SNX27. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di SNX27

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 1, con una parentesi dove si trova SNX27. SNX27 e 30 geni nelle vicinanze sul cromosoma 1, da 151.155.565 a 152.155.564.Cromosoma 11q21.3p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44151,2 Mb151,4 Mb151,6 Mb151,8 Mb152 MbTIPE2: 151.156.621–151.160.255, filamento direttoSCNM1: 151.156.664–151.179.006, filamento direttoSCNM1LYSMD1: 151.159.748–151.165.948, filamento inversoTMOD4: 151.169.984–151.176.284, filamento inversoTMOD4VPS72: 151.176.304–151.195.321, filamento inversoVPS72PIP5K1A: 151.197.949–151.249.538, filamento direttoPIP5K1APSMD4: 151.254.709–151.279.502, filamento direttoPSMD4ZNF687: 151.281.502–151.292.180, filamento direttoZNF687PI4KB: 151.291.792–151.328.394, filamento inversoPI4KBRFX5: 151.340.640–151.347.339, filamento inversoRFX5SELENBP1: 151.364.157–151.372.716, filamento inversoSELENBP1PSMB4: 151.399.556–151.401.941, filamento direttoPSMB4POGZ: 151.402.724–151.459.511, filamento inversoPOGZCGN: 151.510.139–151.538.692, filamento direttoCGNTUFT1: 151.540.305–151.583.583, filamento direttoTUFT1SNX27: 151.612.050–151.699.080, filamento direttoSNX27CELF3: 151.700.058–151.716.803, filamento inversoCELF3RIIAD1: 151.710.433–151.729.805, filamento direttoRIIAD1MRPL9: 151.759.643–151.763.522, filamento inversoMRPL9OAZ3: 151.762.899–151.771.334, filamento direttoOAZ3TDRKH: 151.769.799–151.791.416, filamento inversoTDRKHLINGO4: 151.800.264–151.805.419, filamento inversoLINGO4RORC: 151.806.021–151.831.845, filamento inversoRORCC2CD4D: 151.837.818–151.840.557, filamento inversoC2CD4DTHEM5: 151.847.101–151.853.712, filamento inversoTHEM5THEM4: 151.870.866–151.909.879, filamento inversoTHEM4S100A10: 151.981.697–151.993.891, filamento inversoS100A10S100A11: 152.032.504–152.047.907, filamento inversoS100A11TCHHL1: 152.084.141–152.089.064, filamento inversoTCHHL1TCHH: 152.106.317–152.115.444, filamento inversoTCHHRPTN: 152.153.595–152.159.228, filamento inversoRPTNDiagramma di SNX27: 12 esoni sul filamento diretto del cromosoma 1Esone 1: 151.612.050–151.612.512, 463 basiEsone 2: 151.638.888–151.639.119, 232 basiEsone 3: 151.658.235–151.658.427, 193 basiEsone 4: 151.660.798–151.660.862, 65 basiEsone 5: 151.662.166–151.662.270, 105 basiEsone 6: 151.665.933–151.666.011, 79 basiEsone 7: 151.668.472–151.668.635, 164 basiEsone 8: 151.683.356–151.683.445, 90 basiEsone 9: 151.692.435–151.692.584, 150 basiEsone 10: 151.692.911–151.693.039, 129 basiEsone 11: 151.693.424–151.693.483, 60 basiEsone 12: 151.694.370–151.699.080, 4711 basi1246810125′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 6,4 kb dei 87 kb del gene; 1626 di queste basi codificano la proteina.

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.

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Dante Labs. (s.d.). Gene SNX27: sorting nexin 27. Consultato il 16 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/snx27

Vancouver

Dante Labs. Gene SNX27: sorting nexin 27 [Internet]. [citato il 16 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/snx27

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