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Gene

SLC9A9

solute carrier family 9 member A9

Sintesi

Localizzazione citogenetica
3q24
Coordinate
Cromosoma 3: 143.265.222–143.848.468 (GRCh38)
Esoni
16 esoni su 583,2 kb
Proteina
645 amminoacidi
Noto anche come
FLJ35613, NHE9
Trascritto MANE Select
ENST00000316549.11NM_173653.4
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Genoma di riferimentoGRCh38

Le posizioni nelle pagine di geni e varianti seguono questa scelta, in questo browser.

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora SLC9A9. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di SLC9A9

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Siti noti causativi di malattia
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 3, con una parentesi dove si trova SLC9A9. SLC9A9 e 7 geni nelle vicinanze sul cromosoma 3, da 142.681.975 a 144.431.715.Cromosoma 33q24p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q29143 Mb143,5 Mb144 MbPLS1: 142.595.644–142.713.869, filamento direttoPLS1TRPC1: 142.724.000–142.807.888, filamento direttoTRPC1PCOLCE2: 142.815.922–142.889.211, filamento inversoPCOLCE2PAQR9: 142.949.164–142.964.022, filamento inversoPAQR9U2SURP: 142.964.497–143.061.401, filamento direttoU2SURPCHST2: 143.119.722–143.124.014, filamento direttoCHST2SLC9A9: 143.265.222–143.848.468, filamento inversoSLC9A9DIPK2A: 143.971.816–144.048.719, filamento direttoDIPK2ADiagramma di SLC9A9: 16 esoni sul filamento inverso del cromosoma 3Esone 16: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 16: 143.265.222–143.266.929, 1708 basiEsone 15: 143.268.875–143.268.980, 106 basiEsone 14: 143.363.484–143.363.563, 80 basiEsone 13: 143.382.060–143.382.114, 55 basiEsone 12: 143.467.037–143.467.190, 154 basiEsone 11: 143.493.653–143.493.764, 112 basiEsone 10: 143.495.335–143.495.448, 114 basiEsone 9: 143.552.362–143.552.450, 89 basiEsone 8: 143.574.088–143.574.193, 106 basiEsone 7: 143.578.585–143.578.723, 139 basiEsone 6: 143.652.255–143.652.360, 106 basiEsone 5: 143.693.192–143.693.307, 116 basiEsone 4: 143.795.001–143.795.077, 77 basiEsone 3: 143.796.826–143.796.903, 78 basiEsone 2: 143.832.019–143.832.221, 203 basiEsone 1: 143.848.148–143.848.468, 321 basi16141210864215′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 3,6 kb dei 583,2 kb del gene; 1938 di queste basi codificano la proteina.

Come un test genomico legge SLC9A9

1

posizione in SLC9A9 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena

Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.

Un genoma intero copre tutti i 583,2 kb di SLC9A9, introni inclusi, non solo i 3,6 kb di esoni.

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
  • Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.

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Dante Labs. (s.d.). Gene SLC9A9: solute carrier family 9 member A9. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/slc9a9

Vancouver

Dante Labs. Gene SLC9A9: solute carrier family 9 member A9 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/slc9a9

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