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Gene

PAGR1

PAXIP1 associated glutamate rich protein 1

Sintesi

Localizzazione citogenetica
16p11.2
Coordinate
Cromosoma 16: 29.816.152–29.822.489 (GRCh38)
Esoni
3 esoni su 6,3 kb
Proteina
254 amminoacidi
Noto anche come
MGC4606, GAS, PA1
Simboli precedenti
C16orf53
Trascritto MANE Select
ENST00000320330.8NM_024516.4
Tipo di locus
gene with protein product

Genoma di riferimentoGRCh38

Le posizioni nelle pagine di geni e varianti seguono questa scelta, in questo browser.

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora PAGR1. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di PAGR1

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
Cromosoma 16, con una parentesi dove si trova PAGR1. PAGR1 e 39 geni nelle vicinanze sul cromosoma 16, da 29.319.321 a 30.319.320.Cromosoma 1616p11.2p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.329,4 Mb29,6 Mb29,8 Mb30 Mb30,2 MbNPIPB11: 29.381.310–29.406.711, filamento inversoNPIPB11BOLA2-SMG1P6: 29.443.230–29.454.651, filamento inversoBOLA2: 29.453.587–29.455.012, filamento inversoBOLA2SLX1B: 29.454.501–29.458.223, filamento direttoSLX1BSULT1A4: 29.458.993–29.464.979, filamento direttoSULT1A4NPIPB12: 29.483.534–29.508.595, filamento inversoNPIPB12QPRT: 29.662.957–29.698.704, filamento direttoQPRTSPN: 29.662.957–29.670.876, filamento direttoSPNC16orf54: 29.742.463–29.746.079, filamento inversoC16orf54ZG16: 29.760.591–29.783.885, filamento direttoZG16KIF22: 29.790.137–29.805.388, filamento direttoMAZ: 29.805.637–29.811.176, filamento direttoPRRT2: 29.811.382–29.815.892, filamento direttoPRRT2: 29.812.261–29.820.092, filamento direttoPAGR1: 29.816.152–29.822.489, filamento direttoPAGR1: 29.817.239–29.830.627, filamento direttoMVP: 29.820.394–29.848.039, filamento direttoCDIPT: 29.857.474–29.863.414, filamento inversoSEZ6L2: 29.871.159–29.899.582, filamento inversoSEZ6L2ASPHD1: 29.900.363–29.919.864, filamento direttoASPHD1KCTD13: 29.903.877–29.926.236, filamento inversoKCTD13TMEM219: 29.940.885–29.973.052, filamento direttoTMEM219TAOK2: 29.973.675–29.992.262, filamento direttoTAOK2HIRIP3: 29.992.314–29.996.126, filamento inversoHIRIP3INO80E: 29.994.983–30.005.794, filamento direttoINO80EDOC2A: 30.005.507–30.023.270, filamento inversoFIMP1: 30.023.198–30.027.736, filamento direttoFIMP1TLCD3B: 30.024.425–30.052.978, filamento inverso: 30.053.101–30.071.526, filamento direttoALDOA: 30.064.164–30.070.457, filamento direttoALDOAPPP4C: 30.075.967–30.085.391, filamento direttoPPP4CTBX6: 30.085.793–30.091.933, filamento inversoTBX6YPEL3: 30.092.314–30.096.915, filamento inversoGDPD3: 30.104.810–30.114.034, filamento inversoMAPK3: 30.114.104–30.123.506, filamento inversoCORO1A: 30.182.798–30.189.085, filamento direttoCORO1ABOLA2B: 30.192.928–30.194.306, filamento inversoBOLA2BSLX1A: 30.193.875–30.197.566, filamento direttoSLX1ASULT1A3: 30.198.059–30.204.324, filamento direttoSULT1A3NPIPB13: 30.222.893–30.255.268, filamento inversoDiagramma di PAGR1: 3 esoni sul filamento diretto del cromosoma 16Esone 1: 29.816.152–29.817.007, 856 basiEsone 2: 29.817.210–29.817.292, 83 basiEsone 3: 29.819.555–29.822.489, 2935 basi1235′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 3,9 kb dei 6,3 kb del gene; 765 di queste basi codificano la proteina.

Come un test genomico legge PAGR1

1

posizione in PAGR1 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena

Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.

Un genoma intero copre tutti i 6,3 kb di PAGR1, introni inclusi, non solo i 3,9 kb di esoni.

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
  • Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.

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Dante Labs. (s.d.). Gene PAGR1: PAXIP1 associated glutamate rich protein 1. Consultato il 16 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/pagr1

Vancouver

Dante Labs. Gene PAGR1: PAXIP1 associated glutamate rich protein 1 [Internet]. [citato il 16 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/pagr1

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