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Gene

FAM91A1

family with sequence similarity 91 member A1

Sintesi

Localizzazione citogenetica
8q24.13
Coordinate
Cromosoma 8: 123.768.439–123.815.452 (GRCh38)
Esoni
24 esoni su 47 kb
Proteina
838 amminoacidi
Noto anche come
FLJ23790
Trascritto MANE Select
ENST00000334705.12NM_144963.4
Tipo di locus
Codificanti per proteine
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora FAM91A1. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di FAM91A1

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 8, con una parentesi dove si trova FAM91A1. FAM91A1 e 6 geni nelle vicinanze sul cromosoma 8, da 123.291.946 a 124.291.945.Cromosoma 88q24.13p23.3p23.2p23.1p22p21.3p21.2p21.1p12p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q21.11q21.12q21.13q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.3123,4 Mb123,6 Mb123,8 Mb124 Mb124,2 MbATAD2: 123.319.850–123.416.350, filamento inversoATAD2NTAQ1: 123.416.720–123.470.028, filamento direttoNTAQ1FBXO32: 123.497.889–123.541.273, filamento inversoFBXO32KLHL38: 123.643.039–123.653.808, filamento inversoKLHL38ANXA13: 123.680.794–123.737.442, filamento inversoANXA13FAM91A1: 123.768.439–123.815.452, filamento direttoFAM91A1FER1L6: 123.851.987–124.122.188, filamento direttoFER1L6Diagramma di FAM91A1: 24 esoni sul filamento diretto del cromosoma 8Esone 1: 123.768.439–123.768.774, 336 basiEsone 2: 123.774.080–123.774.164, 85 basiEsone 3: 123.775.147–123.775.298, 152 basiEsone 4: 123.777.265–123.777.322, 58 basiEsone 5: 123.778.025–123.778.092, 68 basiEsone 6: 123.778.659–123.778.772, 114 basiEsone 7: 123.779.985–123.780.075, 91 basiEsone 8: 123.780.480–123.780.542, 63 basiEsone 9: 123.784.470–123.784.576, 107 basiEsone 10: 123.785.081–123.785.119, 39 basiEsone 11: 123.785.629–123.785.741, 113 basiEsone 12: 123.786.495–123.786.610, 116 basiEsone 13: 123.787.261–123.787.373, 113 basiEsone 14: 123.787.664–123.787.750, 87 basiEsone 15: 123.789.613–123.789.745, 133 basiEsone 16: 123.798.090–123.798.238, 149 basiEsone 17: 123.799.520–123.799.654, 135 basiEsone 18: 123.799.772–123.799.885, 114 basiEsone 19: 123.805.267–123.805.339, 73 basiEsone 20: 123.806.080–123.806.229, 150 basiEsone 21: 123.808.272–123.808.376, 105 basiEsone 22: 123.808.893–123.809.016, 124 basiEsone 23: 123.810.282–123.810.351, 70 basiEsone 24: 123.812.519–123.815.452, 2934 basi1246810121416182022245′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 5,5 kb dei 47 kb del gene; 2517 di queste basi codificano la proteina.

Sequenziamento di FAM91A1

45Difficile

Quanto è difficile sequenziare FAM91A1 con letture corte, su 100

Gran parte di FAM91A1 si trova in punti in cui le letture corte possono non rilevare o collocare in modo errato una variante.

A questo si aggiunge la quota degli esoni di FAM91A1 in ciascun tipo di regione difficile

  • Mappabilità17%
  • Omologia53%
  • Condiviso con chrY0%
  • Copertura del riferimento0%
  • Ripetizioni3,3%
  • Contenuto di GC14%

Un punteggio di Dante Labs basato su nostre ricerche, costruito sulle mappe Genome in a Bottle del NIST delle regioni difficili da sequenziare.Come viene calcolato il punteggio

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.

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Dante Labs. (s.d.). Gene FAM91A1: family with sequence similarity 91 member A1. Consultato il 20 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/fam91a1

Vancouver

Dante Labs. Gene FAM91A1: family with sequence similarity 91 member A1 [Internet]. [citato il 20 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/fam91a1

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