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Gene

EBF2

EBF transcription factor 2

Sintesi

Localizzazione citogenetica
8p21.2
Coordinate
Cromosoma 8: 25.841.725–26.045.413 (GRCh38)
Esoni
16 esoni su 203,7 kb
Proteina
575 amminoacidi
Noto anche come
FLJ11500, COE2
Trascritto MANE Select
ENST00000520164.6NM_022659.4
Tipo di locus
Codificanti per proteine
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora EBF2. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di EBF2

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 8, con una parentesi dove si trova EBF2. EBF2 e 4 geni nelle vicinanze sul cromosoma 8, da 25.443.569 a 26.443.568.Cromosoma 88p21.2p23.3p23.2p23.1p22p21.3p21.2p21.1p12p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q21.11q21.12q21.13q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.325,6 Mb25,8 Mb26 Mb26,2 Mb26,4 MbKCTD9: 25.427.455–25.458.476, filamento inversoKCTD9CDCA2: 25.459.199–25.508.491, filamento direttoCDCA2EBF2: 25.841.725–26.045.413, filamento inversoEBF2PPP2R2A: 26.291.507–26.372.692, filamento direttoPPP2R2ABNIP3L: 26.383.031–26.505.636, filamento direttoBNIP3LDiagramma di EBF2: 16 esoni sul filamento inverso del cromosoma 8Esone 16: 25.841.725–25.844.640, 2916 basiEsone 15: 25.850.594–25.850.761, 168 basiEsone 14: 25.858.319–25.858.504, 186 basiEsone 13: 25.861.049–25.861.226, 178 basiEsone 12: 25.861.309–25.861.374, 66 basiEsone 11: 25.862.709–25.862.797, 89 basiEsone 10: 25.886.755–25.886.881, 127 basiEsone 9: 25.887.842–25.887.972, 131 basiEsone 8: 25.889.752–25.889.869, 118 basiEsone 7: 25.908.474–25.908.555, 82 basiEsone 6: 26.033.085–26.033.153, 69 basiEsone 5: 26.040.028–26.040.101, 74 basiEsone 4: 26.040.616–26.040.671, 56 basiEsone 3: 26.040.939–26.041.002, 64 basiEsone 2: 26.042.095–26.042.251, 157 basiEsone 1: 26.044.729–26.045.413, 685 basi161510515′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 5,2 kb dei 203,7 kb del gene; 1728 di queste basi codificano la proteina.

Sequenziamento di EBF2

1Facile

Quanto è difficile sequenziare EBF2 con letture corte, su 100

Quasi tutti gli esoni di EBF2 si trovano in regioni in cui le letture corte si allineano in modo chiaro.

A ciò si aggiunge: la quota di esoni di EBF2 in ciascun tipo di regione difficile

  • Mappabilità0%
  • Omologia0%
  • Ripetizioni3,8%
  • Contenuto GC8,4%
  • Copertura del riferimento0%

Un punteggio di Dante Labs basato su nostre ricerche, costruito sulle mappe delle regioni difficili da sequenziare di NIST Genome in a Bottle.Come viene calcolato

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.

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Dante Labs. (s.d.). Gene EBF2: EBF transcription factor 2. Consultato il 19 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/ebf2

Vancouver

Dante Labs. Gene EBF2: EBF transcription factor 2 [Internet]. [citato il 19 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/ebf2

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