Gå til indhold
Brug dine HSA- eller FSA-midler
Sekvenér dit genom (åbnes i en ny fane)

Gen

PCDH20

protocadherin 20

Oversigt

Cytogenetisk placering
13q21.2
Koordinater
Kromosom 13: 61.409.685–61.415.849 (GRCh38)
Exoner
2 exoner fordelt over 6,2 kb
Protein
951 aminosyrer
Også kendt som
PCDH13, FLJ22218
MANE Select-transkript
ENST00000409204.5NM_022843.4
Lokustype
Proteinkodende
  • Meget høj
  • Sikker
  • Lav
  • Meget lav

Kurerede rapporter relevant for dette gen

Ingen Genome Test-rapport læser PCDH20 endnu. Testen sekventerer hele dit genom, så dine data omfatter det alligevel.

Sådan er PCDH20 opbygget

  • Kodende sekvens
  • Utranslateret region
  • Intron
  • Transkriptionsretning
Kromosom 13, med en klamme ved PCDH20. PCDH20 og 1 gen i nærheden på kromosom 13, fra 60.912.767 til 61.912.766.Kromosom 1313q21.2p13p12p11.2p11.1q11q12.11q12.12q12.13q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.11q14.12q14.13q14.2q14.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q3461 Mb61,2 Mb61,4 Mb61,6 Mb61,8 MbPCDH20: 61.409.685–61.415.849, omvendt-strengPCDH20: 61.409.858–61.427.849, omvendt-strengDiagram af PCDH20: 2 exoner på omvendt-strengen af kromosom 13Exon 2: 61.409.685–61.413.966, 4.282 baserExon 1: 61.415.027–61.415.849, 823 baser215′3′

Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.

Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.

Eksoner udgør 5,1 kb af genets 6,2 kb; 2.856 af disse baser koder for proteinet.

Sekventering af PCDH20

4Let

Hvor svær PCDH20 er at sekventere med korte reads, ud af 100

Næsten alle eksonerne i PCDH20 ligger, hvor korte reads kan kortlægges uden problemer.

Det der forstærker det: andelen af PCDH20s eksoner i hver type svært område

  • Mappability0 %
  • Homologi0 %
  • Delt med chrY0 %
  • Referencedækning0 %
  • Gentagelser3 %
  • GC-indhold18 %

En Dante Labs-score baseret på vores egen forskning, bygget på NIST's Genome in a Bottle-kort over svært sekventerbare regioner.Sådan scores det

Eksterne links

Hvor det kommer fra

  • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
  • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
  • Genome in a Bottle-genomstratifikationerne fra NIST: sekvenseringsvanskelighedsscoren.

Citér denne side

APA

Dante Labs. (u.d.). PCDH20-genet: protocadherin 20. Hentet 20. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/pcdh20

Vancouver

Dante Labs. PCDH20-genet: protocadherin 20 [Internet]. [citeret 20. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/pcdh20

Én test. Svar for hele livet.

Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger

Bestil min Genome Test