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Gene

ZSWIM3

zinc finger SWIM-type containing 3

Sintesi

Localizzazione citogenetica
20q13.12
Coordinate
Cromosoma 20: 45.857.614–45.879.122 (GRCh38)
Esoni
2 esoni su 21,5 kb
Proteina
696 amminoacidi
Noto anche come
dJ337O18.7, PPP1R174
Simboli precedenti
C20orf164
Trascritto MANE Select
ENST00000255152.3NM_080752.4
Tipo di locus
Codificanti per proteine
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora ZSWIM3. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di ZSWIM3

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 20, con una parentesi dove si trova ZSWIM3. ZSWIM3 e 37 geni nelle vicinanze sul cromosoma 20, da 45.368.368 a 46.368.367.Cromosoma 2020q13.12p13p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.3345,4 Mb45,6 Mb45,8 Mb46 Mb46,2 MbSYS1: 45.359.977–45.376.798, filamento direttoSYS1SYS1-DBNDD2: 45.363.200–45.410.610, filamento direttoSYS1-DBNDD2TP53TG5: 45.371.804–45.407.889, filamento inversoTP53TG5DBNDD2: 45.405.616–45.410.870, filamento direttoDBNDD2PIGT: 45.416.084–45.456.934, filamento direttoPIGTWFDC2: 45.469.166–45.481.533, filamento direttoWFDC2SPINT3: 45.512.461–45.515.622, filamento inversoWFDC6: 45.533.091–45.539.496, filamento inversoWFDC6EPPIN-WFDC6: 45.534.196–45.547.662, filamento inversoEPPIN-WFDC6EPPIN: 45.540.626–45.547.786, filamento inversoEPPINWFDC8: 45.551.153–45.579.326, filamento inversoWFDC8WFDC9: 45.607.939–45.631.284, filamento inversoWFDC9WFDC10A: 45.629.733–45.631.196, filamento direttoWFDC10AWFDC11: 45.648.563–45.670.270, filamento inversoWFDC11WFDC10B: 45.684.651–45.705.019, filamento inversoWFDC10BWFDC13: 45.702.038–45.708.817, filamento direttoWFDC13SPINT4: 45.722.347–45.725.830, filamento direttoSPINT4WFDC3: 45.747.944–45.791.932, filamento inversoWFDC3DNTTIP1: 45.791.937–45.811.427, filamento direttoUBE2C: 45.812.561–45.816.965, filamento direttoUBE2CTNNC2: 45.823.214–45.833.745, filamento inversoSNX21: 45.833.633–45.843.276, filamento direttoACOT8: 45.841.709–45.857.435, filamento inversoACOT8ZSWIM3: 45.857.614–45.879.122, filamento direttoZSWIM3ZSWIM1: 45.881.201–45.885.266, filamento direttoZSWIM1SPATA25: 45.886.491–45.887.626, filamento inversoSPATA25NEURL2: 45.888.002–45.891.220, filamento inversoCTSA: 45.890.144–45.898.949, filamento direttoPLTP: 45.897.535–45.912.235, filamento inversoPCIF1: 45.934.673–45.948.023, filamento direttoPCIF1ZNF335: 45.948.653–45.972.358, filamento inversoZNF335MMP9: 46.008.869–46.016.561, filamento direttoMMP9SLC12A5: 46.021.675–46.060.150, filamento direttoSLC12A5NCOA5: 46.060.984–46.089.973, filamento inversoNCOA5CD40: 46.118.240–46.130.378, filamento direttoCD40CDH22: 46.173.737–46.309.009, filamento inversoCDH22SLC35H1: 46.345.980–46.364.460, filamento inversoSLC35H1ELMO2: 46.366.045–46.432.985, filamento inversoELMO2Diagramma di ZSWIM3: 2 esoni sul filamento diretto del cromosoma 20Esone 1: 45.857.614–45.857.980, 367 basiEsone 2: 45.876.714–45.879.122, 2409 basi125′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 2,8 kb dei 21,5 kb del gene; 2091 di queste basi codificano la proteina.

Sequenziamento di ZSWIM3

0Bassa

Quanto è difficile sequenziare ZSWIM3 con letture corte, su 100

  • Mappabilità0%
  • Omologia0%
  • Ripetizioni0%
  • Contenuto di GC1,7%
  • Copertura di riferimento0%

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.

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Dante Labs. (s.d.). Gene ZSWIM3: zinc finger SWIM-type containing 3. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/zswim3

Vancouver

Dante Labs. Gene ZSWIM3: zinc finger SWIM-type containing 3 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/zswim3

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