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Gene

GATD1

glutamine amidotransferase class 1 domain containing 1

Sintesi

Localizzazione citogenetica
11p15.5
Coordinate
Cromosoma 11: 767.222–777.487 (GRCh38)
Esoni
8 esoni su 10,3 kb
Proteina
220 amminoacidi
Noto anche come
FLJ34283, Fy-5, FERRY5
Simboli precedenti
PDDC1
Trascritto MANE Select
ENST00000319863.13NM_182612.4
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Genoma di riferimentoGRCh38

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Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora GATD1. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di GATD1

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 11, con una parentesi dove si trova GATD1. GATD1 e 44 geni nelle vicinanze sul cromosoma 11, da 272.355 a 1.272.354.Cromosoma 1111p15.5p15.5p15.4p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12p11.2p11.12p11.11q11q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q13.4q13.5q14.1q14.2q14.3q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q250,4 Mb0,6 Mb0,8 Mb1 Mb1,2 MbNLRP6: 278.407–286.691, filamento direttoPGGHG: 289.078–297.510, filamento direttoIFITM5: 298.200–299.533, filamento inversoIFITM2: 303.655–309.410, filamento direttoIFITM2: 308.408–315.272, filamento direttoIFITM3: 309.010–329.475, filamento inversoIFITM3IFITM1: 309.997–315.275, filamento direttoIFITM1B4GALNT4: 369.457–382.117, filamento direttoB4GALNT4PKP3: 392.574–404.908, filamento direttoPKP3SIGIRR: 405.711–417.473, filamento inversoSIGIRRANO9: 417.921–442.072, filamento inversoANO9PTDSS2: 448.268–501.142, filamento direttoPTDSS2RNH1: 494.510–507.395, filamento inversoRNH1HRAS: 532.242–537.343, filamento inversoHRASLRRC56: 536.841–554.925, filamento direttoLRRC56LMNTD2: 554.850–560.743, filamento inversoLMNTD2RASSF7: 560.207–564.067, filamento direttoRASSF7PHRF1: 576.170–612.263, filamento direttoIRF7: 612.551–615.983, filamento inversoIRF7CDHR5: 616.405–626.078, filamento inversoCDHR5SCT: 626.309–627.236, filamento inversoSCTDRD4: 637.269–640.706, filamento direttoDRD4DEAF1: 644.220–707.118, filamento inversoDEAF1EPS8L2: 694.438–727.729, filamento direttoEPS8L2TMEM80: 695.011–705.028, filamento direttoTMEM80TALDO1: 747.399–765.035, filamento direttoTALDO1GATD1: 767.222–777.487, filamento inversoGATD1CEND1: 785.900–790.113, filamento inversoCEND1SLC25A22: 790.474–798.321, filamento inversoSLC25A22PANO1: 797.511–799.190, filamento direttoPIDD1: 798.938–809.753, filamento inversoRPLP2: 799.414–812.891, filamento diretto: 803.398–804.419, filamento inversoPNPLA2: 818.907–825.573, filamento direttoCRACR2B: 826.137–831.993, filamento direttoCD151: 832.702–839.831, filamento direttoPOLR2L: 837.356–842.727, filamento inversoTSPAN4: 840.686–867.120, filamento direttoTSPAN4CHID1: 866.873–915.579, filamento inversoCHID1AP2A2: 924.881–1.012.245, filamento direttoAP2A2MUC6: 1.012.823–1.036.718, filamento inversoMUC6MUC2: 1.074.875–1.110.511, filamento direttoMUC2MUC5AC: 1.157.953–1.201.138, filamento direttoMUC5ACMUC5B: 1.223.066–1.262.172, filamento direttoMUC5BTOLLIP: 1.264.771–1.310.258, filamento inversoTOLLIPDiagramma di GATD1: 8 esoni sul filamento inverso del cromosoma 11Esone 8: 767.222–770.903, 3682 basiEsone 7: 770.993–771.104, 112 basiEsone 6: 771.333–771.426, 94 basiEsone 5: 772.427–772.521, 95 basiEsone 4: 773.522–773.629, 108 basiEsone 3: 774.008–774.113, 106 basiEsone 2: 775.066–775.142, 77 basiEsone 1: 777.399–777.487, 89 basi876543215′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 4,4 kb dei 10,3 kb del gene; 663 di queste basi codificano la proteina.

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.

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Dante Labs. (s.d.). Gene GATD1: glutamine amidotransferase class 1 domain containing 1. Consultato il 16 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/gatd1

Vancouver

Dante Labs. Gene GATD1: glutamine amidotransferase class 1 domain containing 1 [Internet]. [citato il 16 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/gatd1

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