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Gene

FAM171A2

family with sequence similarity 171 member A2

Sintesi

Localizzazione citogenetica
17q21.31
Coordinate
Cromosoma 17: 44.353.215–44.363.853 (GRCh38)
Esoni
8 esoni su 10,6 kb
Proteina
826 amminoacidi
Noto anche come
MGC34829
Trascritto MANE Select
ENST00000293443.12NM_198475.3
Tipo di locus
Protein-coding
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora FAM171A2. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di FAM171A2

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 17, con una parentesi dove si trova FAM171A2. FAM171A2 e 28 geni nelle vicinanze sul cromosoma 17, da 43.858.534 a 44.858.533.Cromosoma 1717q21.31p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.344 Mb44,2 Mb44,4 Mb44,6 Mb44,8 MbCD300LG: 43.847.114–43.863.639, filamento direttoCD300LGMPP2: 43.875.352–43.909.711, filamento inversoMPP2PPY: 43.940.804–43.952.444, filamento inversoPPYPYY: 43.952.733–44.004.469, filamento inversoPYYNAGS: 44.004.581–44.011.213, filamento direttoNAGSTMEM101: 44.008.986–44.023.946, filamento inversoTMEM101LSM12: 44.033.931–44.067.619, filamento inversoLSM12G6PC3: 44.070.620–44.094.678, filamento direttoG6PC3HDAC5: 44.076.746–44.123.702, filamento inversoHDAC5HROB: 44.141.903–44.162.481, filamento direttoHROBASB16: 44.170.447–44.179.373, filamento direttoASB16TMUB2: 44.186.955–44.191.931, filamento direttoTMUB2ATXN7L3: 44.191.804–44.200.961, filamento inversoATXN7L3UBTF: 44.205.033–44.221.626, filamento inversoUBTFSLC4A1: 44.248.390–44.268.162, filamento inversoSLC4A1RUNDC3A: 44.307.945–44.318.675, filamento direttoRUNDC3ASLC25A39: 44.316.821–44.326.639, filamento inversoSLC25A39GRN: 44.345.108–44.353.106, filamento direttoGRNFAM171A2: 44.353.215–44.363.853, filamento inversoFAM171A2ITGA2B: 44.372.177–44.389.649, filamento inversoITGA2BGPATCH8: 44.395.281–44.503.639, filamento inversoGPATCH8FZD2: 44.557.484–44.561.262, filamento direttoFZD2MEIOC: 44.656.363–44.690.308, filamento direttoMEIOCCCDC43: 44.671.063–44.689.831, filamento inversoCCDC43DBF4B: 44.708.595–44.752.269, filamento direttoDBF4BADAM11: 44.758.962–44.781.846, filamento direttoADAM11GJC1: 44.798.448–44.831.496, filamento inversoGJC1HIGD1B: 44.844.763–44.850.480, filamento direttoHIGD1BEFTUD2: 44.849.948–44.899.629, filamento inversoEFTUD2Diagramma di FAM171A2: 8 esoni sul filamento inverso del cromosoma 17Esone 8: 44.353.215–44.355.191, 1977 basiEsone 7: 44.355.715–44.355.841, 127 basiEsone 6: 44.355.958–44.356.074, 117 basiEsone 5: 44.356.173–44.356.352, 180 basiEsone 4: 44.356.430–44.356.588, 159 basiEsone 3: 44.359.579–44.359.671, 93 basiEsone 2: 44.359.905–44.360.132, 228 basiEsone 1: 44.363.597–44.363.853, 257 basi876543215′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 3,1 kb dei 10,6 kb del gene; 2481 di queste basi codificano la proteina.

Sequenziamento di FAM171A2

2

posizioni in FAM171A2 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena

Nessuna di queste ricade in una regione che le letture corte faticano a leggere.

Un genoma intero copre tutti i 10,6 kb di FAM171A2, introni compresi, non solo i 3,1 kb di esoni.

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
  • Rilascio dei dati 2026.10.17-8666dff2.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gene FAM171A2: family with sequence similarity 171 member A2. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/fam171a2

Vancouver

Dante Labs. Gene FAM171A2: family with sequence similarity 171 member A2 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/fam171a2

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