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Gene

CX3CL1

C-X3-C motif chemokine ligand 1

Sintesi

Localizzazione citogenetica
16q21
Coordinate
Cromosoma 16: 57.372.490–57.385.044 (GRCh38)
Esoni
3 esoni su 12,6 kb
Proteina
397 amminoacidi
Noto anche come
NTN, C3Xkine, ABCD-3, CXC3C, CXC3
Simboli precedenti
SCYD1
Trascritto MANE Select
ENST00000006053.7NM_002996.6
Tipo di locus
Protein-coding
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora CX3CL1. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di CX3CL1

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
Cromosoma 16, con una parentesi dove si trova CX3CL1. CX3CL1 e 22 geni nelle vicinanze sul cromosoma 16, da 56.878.767 a 57.878.766.Cromosoma 1616q21p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.357 Mb57,2 Mb57,4 Mb57,6 Mb57,8 MbSLC12A3: 56.865.203–56.915.850, filamento direttoSLC12A3HERPUD1: 56.930.815–56.946.491, filamento direttoHERPUD1CETP: 56.961.922–56.983.845, filamento direttoCETPNLRC5: 56.989.485–57.084.238, filamento direttoNLRC5CPNE2: 57.092.517–57.148.369, filamento direttoCPNE2PSME3IP1: 57.152.466–57.186.175, filamento inversoPSME3IP1RSPRY1: 57.186.137–57.242.505, filamento direttoRSPRY1ARL2BP: 57.245.098–57.259.830, filamento direttoARL2BPPLLP: 57.248.547–57.284.683, filamento inversoPLLPCCL22: 57.357.925–57.366.191, filamento direttoCCL22CX3CL1: 57.372.490–57.385.044, filamento direttoCX3CL1CCL17: 57.404.767–57.416.063, filamento direttoCCL17CIAPIN1: 57.428.169–57.447.420, filamento inversoCIAPIN1COQ9: 57.447.425–57.461.275, filamento direttoCOQ9POLR2C: 57.462.648–57.472.010, filamento direttoPOLR2CDOK4: 57.471.917–57.487.382, filamento inversoDOK4CCDC102A: 57.511.805–57.537.163, filamento inversoCCDC102AADGRG5: 57.528.585–57.591.681, filamento direttoADGRG5ADGRG1: 57.610.652–57.665.580, filamento direttoADGRG1ADGRG3: 57.668.106–57.689.378, filamento direttoADGRG3DRC7: 57.694.790–57.731.805, filamento direttoDRC7KATNB1: 57.735.669–57.758.271, filamento direttoKATNB1KIFC3: 57.755.668–57.863.053, filamento inversoKIFC3Diagramma di CX3CL1: 3 esoni sul filamento diretto del cromosoma 16Esone 1: 57.372.490–57.372.638, 149 basiEsone 2: 57.379.634–57.379.754, 121 basiEsone 3: 57.382.030–57.385.044, 3015 basi1235′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 3,3 kb dei 12,6 kb del gene; 1194 di queste basi codificano la proteina.

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.

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Dante Labs. (s.d.). Gene CX3CL1: C-X3-C motif chemokine ligand 1. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/cx3cl1

Vancouver

Dante Labs. Gene CX3CL1: C-X3-C motif chemokine ligand 1 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/cx3cl1

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