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Gene

ATG16L2

autophagy related 16 like 2

Sintesi

Localizzazione citogenetica
11q13.4
Coordinate
Cromosoma 11: 72.814.411–72.829.635 (GRCh38)
Esoni
18 esoni su 15,2 kb
Proteina
619 amminoacidi
Noto anche come
FLJ00012, WDR80, ATG16B
Trascritto MANE Select
ENST00000321297.10NM_033388.2
Tipo di locus
Codificanti per proteine
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora ATG16L2. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di ATG16L2

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 11, con una parentesi dove si trova ATG16L2. ATG16L2 e 8 geni nelle vicinanze sul cromosoma 11, da 72.322.023 a 73.322.022.Cromosoma 1111q13.4p15.5p15.4p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12p11.2p11.12p11.11q11q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q13.4q13.5q14.1q14.2q14.3q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q2572,4 Mb72,6 Mb72,8 Mb73 Mb73,2 MbCLPB: 72.285.495–72.434.680, filamento inversoCLPBPDE2A: 72.576.141–72.674.591, filamento inversoPDE2AARAP1: 72.682.436–72.794.047, filamento inversoARAP1STARD10: 72.753.216–72.794.047, filamento inversoSTARD10ATG16L2: 72.814.411–72.829.635, filamento direttoATG16L2FCHSD2: 72.836.042–73.142.485, filamento inversoFCHSD2P2RY2: 73.216.664–73.242.427, filamento direttoP2RY2P2RY6: 73.264.498–73.305.103, filamento direttoP2RY6ARHGEF17: 73.308.276–73.370.786, filamento direttoARHGEF17Diagramma di ATG16L2: 18 esoni sul filamento diretto del cromosoma 11Esone 1: 72.814.411–72.814.563, 153 basiEsone 2: 72.816.728–72.816.827, 100 basiEsone 3: 72.817.756–72.817.855, 100 basiEsone 4: 72.821.668–72.821.741, 74 basiEsone 5: 72.822.044–72.822.295, 252 basiEsone 6: 72.822.478–72.822.543, 66 basiEsone 7: 72.822.848–72.822.961, 114 basiEsone 8: 72.824.060–72.824.122, 63 basiEsone 9: 72.824.734–72.824.842, 109 basiEsone 10: 72.825.302–72.825.407, 106 basiEsone 11: 72.826.173–72.826.243, 71 basiEsone 12: 72.826.518–72.826.589, 72 basiEsone 13: 72.826.703–72.826.823, 121 basiEsone 14: 72.827.188–72.827.293, 106 basiEsone 15: 72.828.359–72.828.508, 150 basiEsone 16: 72.828.729–72.828.776, 48 basiEsone 17: 72.828.883–72.828.984, 102 basiEsone 18: 72.829.303–72.829.635, 333 basi1246810121416185′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 2,1 kb dei 15,2 kb del gene; 1860 di queste basi codificano la proteina.

Sequenziamento di ATG16L2

5Bassa

Quanto è difficile sequenziare ATG16L2 con letture corte, su 100

  • Mappabilità0%
  • Omologia0%
  • Ripetizioni5,3%
  • Contenuto di GC41%
  • Copertura di riferimento0%

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.

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Dante Labs. (s.d.). Gene ATG16L2: autophagy related 16 like 2. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/atg16l2

Vancouver

Dante Labs. Gene ATG16L2: autophagy related 16 like 2 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/atg16l2

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