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Gene

MAB21L3

mab-21 like 3

Sintesi

Localizzazione citogenetica
1p13.1
Coordinate
Cromosoma 1: 116.111.399–116.138.149 (GRCh38)
Esoni
8 esoni su 26,8 kb
Proteina
362 amminoacidi
Noto anche come
FLJ38716, D5
Simboli precedenti
C1orf161
Trascritto MANE Select
ENST00000369500.4NM_152367.3
Tipo di locus
Codificanti per proteine
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora MAB21L3. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di MAB21L3

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 1, con una parentesi dove si trova MAB21L3. MAB21L3 e 7 geni nelle vicinanze sul cromosoma 1, da 115.624.774 a 116.624.773.Cromosoma 11p13.1p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44115,8 Mb116 Mb116,2 Mb116,4 Mb116,6 MbVANGL1: 115.641.854–115.698.224, filamento direttoVANGL1CASQ2: 115.697.988–115.837.921, filamento inversoCASQ2NHLH2: 115.836.377–115.843.917, filamento inversoNHLH2SLC22A15: 115.976.310–116.072.747, filamento direttoSLC22A15MAB21L3: 116.111.399–116.138.149, filamento direttoMAB21L3ATP1A1: 116.372.668–116.410.261, filamento direttoATP1A1CD58: 116.499.485–116.571.061, filamento inversoCD58IGSF3: 116.574.393–116.667.820, filamento inversoIGSF3Diagramma di MAB21L3: 8 esoni sul filamento diretto del cromosoma 1Esone 1: 116.111.399–116.111.510, 112 basiEsone 2: 116.111.629–116.111.810, 182 basiEsone 3: 116.112.407–116.112.663, 257 basiEsone 4: 116.120.932–116.121.072, 141 basiEsone 5: 116.124.066–116.124.357, 292 basiEsone 6: 116.127.466–116.127.644, 179 basiEsone 7: 116.128.145–116.128.339, 195 basiEsone 8: 116.133.132–116.138.149, 5018 basi1585′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 6,4 kb dei 26,8 kb del gene; 1089 di queste basi codificano la proteina.

Sequenziamento di MAB21L3

48Difficile

Quanto è difficile sequenziare MAB21L3 con letture corte, su 100

Gran parte di MAB21L3 si trova in regioni in cui le letture corte possono non rilevare o posizionare erroneamente una variazione.

A ciò si aggiunge: la quota di esoni di MAB21L3 in ciascun tipo di regione difficile

  • Mappabilità47%
  • Omologia0%
  • Shared with chrY0%
  • Copertura del riferimento0%
  • Ripetizioni2,5%
  • Contenuto GC3,3%

Un punteggio di Dante Labs basato su nostre ricerche, costruito sulle mappe delle regioni difficili da sequenziare di NIST Genome in a Bottle.Come viene calcolato

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.

Cita questa pagina

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Dante Labs. (s.d.). Gene MAB21L3: mab-21 like 3. Consultato il 19 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/mab21l3

Vancouver

Dante Labs. Gene MAB21L3: mab-21 like 3 [Internet]. [citato il 19 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/mab21l3

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