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Gene

LSM1

LSM1 homolog, mRNA degradation associated

Sintesi

Localizzazione citogenetica
8p11.23
Coordinate
Cromosoma 8: 38.163.339–38.176.493 (GRCh38)
Esoni
4 esoni su 13,2 kb
Proteina
133 amminoacidi
Noto anche come
CASM, YJL124C
Trascritto MANE Select
ENST00000311351.9NM_014462.3
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Genoma di riferimentoGRCh38

Le posizioni nelle pagine di geni e varianti seguono questa scelta, in questo browser.

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora LSM1. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di LSM1

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 8, con una parentesi dove si trova LSM1. LSM1 e 18 geni nelle vicinanze sul cromosoma 8, da 37.669.916 a 38.669.915.Cromosoma 88p11.23p23.3p23.2p23.1p22p21.3p21.2p21.1p12p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q21.11q21.12q21.13q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.337,8 Mb38 Mb38,2 Mb38,4 Mb38,6 MbZNF703: 37.695.744–37.700.019, filamento direttoZNF703ERLIN2: 37.736.587–37.758.422, filamento direttoERLIN2PLPBP: 37.762.580–37.782.218, filamento direttoPLPBPADGRA2: 37.784.191–37.844.896, filamento direttoADGRA2BRF2: 37.843.268–37.849.911, filamento inversoBRF2RAB11FIP1: 37.858.618–37.899.513, filamento inversoRAB11FIP1GOT1L1: 37.934.281–37.940.162, filamento inversoGOT1L1: 37.934.340–37.965.953, filamento inversoADRB3: 37.962.990–37.966.614, filamento inversoADRB3EIF4EBP1: 38.030.494–38.060.380, filamento direttoEIF4EBP1ASH2L: 38.105.493–38.144.124, filamento direttoASH2LSTAR: 38.138.571–38.151.102, filamento inversoSTARLSM1: 38.163.339–38.176.493, filamento inversoLSM1BAG4: 38.176.533–38.215.427, filamento direttoBAG4DDHD2: 38.225.218–38.283.357, filamento direttoDDHD2PLPP5: 38.263.095–38.269.519, filamento inversoPLPP5NSD3: 38.269.704–38.383.021, filamento inversoNSD3LETM2: 38.386.204–38.409.527, filamento direttoLETM2FGFR1: 38.400.215–38.468.834, filamento inversoFGFR1Diagramma di LSM1: 4 esoni sul filamento inverso del cromosoma 8Esone 4: 38.163.339–38.163.840, 502 basiEsone 3: 38.169.802–38.169.917, 116 basiEsone 2: 38.171.965–38.172.033, 69 basiEsone 1: 38.176.275–38.176.493, 219 basi43215′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 0,9 kb dei 13,2 kb del gene; 402 di queste basi codificano la proteina.

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.

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Dante Labs. (s.d.). Gene LSM1: LSM1 homolog, mRNA degradation associated. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/lsm1

Vancouver

Dante Labs. Gene LSM1: LSM1 homolog, mRNA degradation associated [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/lsm1

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