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Gene

FAM90A5

family with sequence similarity 90 member A5

Sintesi

Localizzazione citogenetica
8p23.1
Coordinate
Cromosoma 8: 7.287.392–7.290.402 (GRCh38)
Esoni
4 esoni su 3 kb
Proteina
464 amminoacidi
Simboli precedenti
FAM90A5P
Trascritto MANE Select
ENST00000528738.1NM_001423529.1
Tipo di locus
Codificanti per proteine
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora FAM90A5. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di FAM90A5

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 8, con una parentesi dove si trova FAM90A5. FAM90A5 e 37 geni nelle vicinanze sul cromosoma 8, da 6.788.897 a 7.788.896.Cromosoma 88p23.1p23.3p23.2p23.1p22p21.3p21.2p21.1p12p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q21.11q21.12q21.13q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.36,8 Mb7 Mb7,2 Mb7,4 Mb7,6 MbXKR5: 6.805.013–6.835.536, filamento inversoXKR5DEFB1: 6.870.592–6.877.943, filamento inversoDEFB1DEFA6: 6.924.697–6.926.076, filamento inversoDEFA6DEFA4: 6.935.820–6.938.313, filamento inversoDEFA4DEFA1: 6.977.649–6.980.094, filamento inversoDEFA1DEFA1B: 6.996.766–6.999.206, filamento inversoDEFA1BDEFA3: 7.015.868–7.018.359, filamento inversoDEFA3DEFA5: 7.055.251–7.056.740, filamento inversoDEFA5FAM90A15: 7.256.904–7.259.914, filamento direttoFAM90A3: 7.264.526–7.267.536, filamento direttoFAM90A3FAM90A13: 7.279.770–7.282.780, filamento direttoFAM90A13FAM90A5: 7.287.392–7.290.402, filamento direttoFAM90A5FAM90A20: 7.295.014–7.298.024, filamento direttoFAM90A20DEFB109B: 7.312.722–7.320.096, filamento direttoUSP17L1: 7.332.387–7.333.979, filamento direttoUSP17L4: 7.337.115–7.338.707, filamento direttoZNF705G: 7.355.517–7.385.558, filamento inversoZNF705GDEFB108C: 7.373.114–7.377.500, filamento direttoDEFB108CDEFB4B: 7.414.855–7.416.863, filamento inversoDEFB4BDEFB103B: 7.428.888–7.430.348, filamento inversoDEFB103BSPAG11B: 7.442.684–7.463.674, filamento inversoSPAG11BDEFB104B: 7.470.308–7.475.082, filamento inversoDEFB104BDEFB106B: 7.482.504–7.486.400, filamento inversoDEFB105B: 7.487.679–7.489.593, filamento direttoDEFB107B: 7.495.911–7.509.311, filamento direttoPRR23D1: 7.539.627–7.542.450, filamento direttoPRR23D1FAM90A7: 7.556.700–7.559.712, filamento inversoFAM90A7FAM90A22: 7.571.995–7.575.006, filamento inversoFAM90A22FAM90A23: 7.579.644–7.582.653, filamento inversoFAM90A23FAM90A14: 7.715.443–7.718.453, filamento direttoFAM90A14FAM90A18: 7.723.091–7.726.101, filamento direttoFAM90A18FAM90A16: 7.730.739–7.733.749, filamento direttoFAM90A16FAM90A8: 7.738.387–7.741.396, filamento direttoFAM90A8FAM90A17: 7.746.034–7.749.044, filamento direttoFAM90A19: 7.751.570–7.756.692, filamento direttoFAM90A9: 7.761.330–7.764.340, filamento direttoFAM90A10: 7.766.902–7.772.547, filamento direttoPRR23D2: 7.778.591–7.781.413, filamento inversoDiagramma di FAM90A5: 4 esoni sul filamento diretto del cromosoma 8Esone 1: 7.287.392–7.287.514, 123 basiEsone 2: 7.288.009–7.288.208, 200 basiEsone 3: 7.288.667–7.288.775, 109 basiEsone 4: 7.289.440–7.290.402, 963 basi12345′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 1,4 kb dei 3 kb del gene; 1395 di queste basi codificano la proteina.

Sequenziamento di FAM90A5

100Difficile

Quanto è difficile sequenziare FAM90A5 con letture corte, su 100

Gran parte di FAM90A5 si trova in punti in cui le letture corte possono non rilevare o collocare in modo errato una variante.

A questo si aggiunge la quota degli esoni di FAM90A5 in ciascun tipo di regione difficile

  • Mappabilità100%
  • Omologia100%
  • Condiviso con chrY0%
  • Copertura del riferimento0%
  • Ripetizioni0%
  • Contenuto di GC53%

Un punteggio di Dante Labs basato su nostre ricerche, costruito sulle mappe Genome in a Bottle del NIST delle regioni difficili da sequenziare.Come viene calcolato il punteggio

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.

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Dante Labs. (s.d.). Gene FAM90A5: family with sequence similarity 90 member A5. Consultato il 19 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/fam90a5

Vancouver

Dante Labs. Gene FAM90A5: family with sequence similarity 90 member A5 [Internet]. [citato il 19 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/fam90a5

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