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Gene

SLX4IP

SLX4 interacting protein

Sintesi

Localizzazione citogenetica
20p12.2
Coordinate
Cromosoma 20: 10.435.305–10.628.030 (GRCh38)
Esoni
8 esoni su 192,7 kb
Proteina
408 amminoacidi
Noto anche come
dJ1099D15.3
Simboli precedenti
C20orf94
Trascritto MANE Select
ENST00000334534.10NM_001009608.3
Tipo di locus
Protein-coding
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora SLX4IP. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di SLX4IP

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 20, con una parentesi dove si trova SLX4IP. SLX4IP e 6 geni nelle vicinanze sul cromosoma 20, da 10.031.668 a 11.031.667.Cromosoma 2020p12.2p13p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.3310,2 Mb10,4 Mb10,6 Mb10,8 Mb11 MbANKEF1: 9.986.126–10.059.414, filamento direttoANKEF1SNAP25: 10.172.395–10.308.258, filamento direttoSNAP25MKKS: 10.401.009–10.434.236, filamento inversoMKKS: 10.411.653–10.434.236, filamento inverso: 10.411.653–10.434.236, filamento inversoSLX4IP: 10.435.305–10.628.030, filamento direttoSLX4IPJAG1: 10.637.684–10.674.396, filamento inversoJAG1Diagramma di SLX4IP: 8 esoni sul filamento diretto del cromosoma 20Esone 1: 10.435.305–10.435.453, 149 basiEsone 2: 10.458.176–10.458.231, 56 basiEsone 3: 10.556.231–10.556.320, 90 basiEsone 4: 10.560.700–10.560.820, 121 basiEsone 5: 10.598.675–10.598.752, 78 basiEsone 6: 10.601.731–10.601.819, 89 basiEsone 7: 10.621.314–10.621.414, 101 basiEsone 8: 10.622.659–10.628.030, 5372 basi123456785′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 6,1 kb dei 192,7 kb del gene; 1227 di queste basi codificano la proteina.

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.

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Dante Labs. (s.d.). Gene SLX4IP: SLX4 interacting protein. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/slx4ip

Vancouver

Dante Labs. Gene SLX4IP: SLX4 interacting protein [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/slx4ip

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