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Gene

SLC38A5

solute carrier family 38 member 5

Sintesi

Localizzazione citogenetica
Xp11.23
Coordinate
Cromosoma X: 48.458.544–48.470.260 (GRCh38)
Esoni
17 esoni su 11,7 kb
Proteina
472 amminoacidi
Noto anche come
SN2, JM24, SNAT5
Trascritto MANE Select
ENST00000620913.5NM_033518.4
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Genoma di riferimentoGRCh38

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Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora SLC38A5. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di SLC38A5

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma X, con una parentesi dove si trova SLC38A5. SLC38A5 e 30 geni nelle vicinanze sul cromosoma X, da 47.964.402 a 48.964.401.Cromosoma XXp11.23p22.33p22.32p22.31p22.2p22.13p22.12p22.11p21.3p21.2p21.1p11.4p11.3p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26.1q26.2q26.3q27.1q27.2q27.3q2848 Mb48,2 Mb48,4 Mb48,6 Mb48,8 MbZNF81: 47.836.471–48.003.066, filamento direttoZNF81ZNF182: 47.974.851–48.004.375, filamento inversoZNF182ZNF630: 47.983.356–48.071.893, filamento inversoZNF630SPACA5: 48.004.336–48.009.735, filamento direttoSPACA5SPACA5B: 48.130.626–48.132.620, filamento direttoSPACA5BSSX5: 48.186.220–48.196.797, filamento inversoSSX5SSX1: 48.255.368–48.267.444, filamento direttoSSX1SSX3: 48.337.725–48.356.750, filamento inversoSSX3SSX4: 48.383.516–48.393.347, filamento direttoSSX4SSX4B: 48.402.082–48.411.960, filamento inversoSSX4BSLC38A5: 48.458.544–48.470.260, filamento inversoSLC38A5FTSJ1: 48.476.021–48.486.364, filamento direttoFTSJ1PORCN: 48.508.574–48.520.814, filamento direttoPORCNEBP: 48.521.089–48.528.716, filamento direttoEBP: 48.521.806–48.545.469, filamento direttoTBC1D25: 48.539.623–48.562.613, filamento direttoTBC1D25RBM3: 48.574.056–48.581.162, filamento direttoRBM3WDR13: 48.589.838–48.608.869, filamento direttoWDR13WAS: 48.676.593–48.691.431, filamento direttoWASSUV39H1: 48.695.554–48.709.556, filamento direttoSUV39H1GLOD5: 48.761.744–48.773.648, filamento direttoGLOD5GATA1: 48.783.122–48.794.311, filamento direttoGATA1HDAC6: 48.801.372–48.824.986, filamento direttoHDAC6ERAS: 48.826.513–48.830.138, filamento direttoERASPCSK1N: 48.831.088–48.835.632, filamento inversoPCSK1NTIMM17B: 48.880.274–48.898.143, filamento inversoTIMM17BPQBP1: 48.890.197–48.903.640, filamento direttoPQBP1SLC35A2: 48.903.180–48.911.958, filamento inversoSLC35A2PIM2: 48.913.172–48.919.546, filamento inversoPIM2OTUD5: 48.922.024–48.958.390, filamento inversoKCND1: 48.960.982–48.971.916, filamento inversoKCND1Diagramma di SLC38A5: 17 esoni sul filamento inverso del cromosoma XEsone 17: 48.458.544–48.459.034, 491 basiEsone 16: 48.459.536–48.459.639, 104 basiEsone 15: 48.459.732–48.459.876, 145 basiEsone 14: 48.460.649–48.460.764, 116 basiEsone 13: 48.460.986–48.461.086, 101 basiEsone 12: 48.461.718–48.461.797, 80 basiEsone 11: 48.462.007–48.462.144, 138 basiEsone 10: 48.462.233–48.462.291, 59 basiEsone 9: 48.462.898–48.462.980, 83 basiEsone 8: 48.466.015–48.466.093, 79 basiEsone 7: 48.466.230–48.466.322, 93 basiEsone 6: 48.466.799–48.466.872, 74 basiEsone 5: 48.466.962–48.467.077, 116 basiEsone 4: 48.467.710–48.467.785, 76 basiEsone 3: 48.467.872–48.467.925, 54 basiEsone 2: 48.469.335–48.469.436, 102 basiEsone 1: 48.470.182–48.470.260, 79 basi1716141210864215′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 2 kb dei 11,7 kb del gene; 1419 di queste basi codificano la proteina.

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.

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Dante Labs. (s.d.). Gene SLC38A5: solute carrier family 38 member 5. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/slc38a5

Vancouver

Dante Labs. Gene SLC38A5: solute carrier family 38 member 5 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/slc38a5

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