Vai al contenuto
Usa i fondi del tuo conto HSA o FSA
Sequenzia il tuo genoma (si apre in una nuova scheda)

Gene

PXYLP1

2-phosphoxylose phosphatase 1

Sintesi

Localizzazione citogenetica
3q23
Coordinate
Cromosoma 3: 141.231.825–141.294.924 (GRCh38)
Esoni
6 esoni su 63,1 kb
Proteina
480 amminoacidi
Noto anche come
FLJ23751
Simboli precedenti
ACPL2
Trascritto MANE Select
ENST00000286353.9NM_001037172.3
Tipo di locus
Codificanti per proteine
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora PXYLP1. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di PXYLP1

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 3, con una parentesi dove si trova PXYLP1. PXYLP1 e 6 geni nelle vicinanze sul cromosoma 3, da 140.763.375 a 141.763.374.Cromosoma 33q23p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q29140,8 Mb141 Mb141,2 Mb141,4 Mb141,6 MbSLC25A36: 140.941.797–140.980.995, filamento direttoSLC25A36SPSB4: 141.050.744–141.148.613, filamento direttoSPSB4PXYLP1: 141.231.825–141.294.924, filamento direttoPXYLP1ZBTB38: 141.324.154–141.449.792, filamento direttoZBTB38RASA2: 141.486.967–141.615.362, filamento direttoRASA2RNF7: 141.738.189–141.747.611, filamento direttoRNF7: 141.738.474–141.807.919, filamento direttoDiagramma di PXYLP1: 6 esoni sul filamento diretto del cromosoma 3Esone 1: 141.231.825–141.231.911, 87 basiEsone 2: 141.260.123–141.260.254, 132 basiEsone 3: 141.278.342–141.278.500, 159 basiEsone 4: 141.279.378–141.279.504, 127 basiEsone 5: 141.287.314–141.287.453, 140 basiEsone 6: 141.292.268–141.294.924, 2657 basi1234565′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 3,3 kb dei 63,1 kb del gene; 1443 di queste basi codificano la proteina.

Sequenziamento PXYLP1

0Facile

Quanto è difficile sequenziare PXYLP1 con letture corte, su 100

Quasi tutti gli esoni di PXYLP1 si trovano in punti in cui le letture corte si allineano in modo chiaro.

Cosa aggrava il quadro: la quota degli esoni di PXYLP1 in ciascun tipo di regione difficile

  • Mappabilità0%
  • Omologia0%
  • Ripetizioni1,5%
  • Contenuto GC2,6%
  • Copertura del riferimento0%

Un punteggio Dante Labs basato su nostre ricerche, costruito sulle mappe delle regioni difficili da sequenziare Genome in a Bottle del NIST.Come viene calcolato il punteggio

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.

Cita questa pagina

APA

Dante Labs. (s.d.). Gene PXYLP1: 2-phosphoxylose phosphatase 1. Consultato il 18 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/pxylp1

Vancouver

Dante Labs. Gene PXYLP1: 2-phosphoxylose phosphatase 1 [Internet]. [citato il 18 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/pxylp1

Un solo test. Risposte per tutta la vita.

A partire da 449 $Spedizione gratuita · Risultati in 6–8 settimane

Ottieni il mio Genome Test