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Gene

HSBP1L1

heat shock factor binding protein 1 like 1

Sintesi

Localizzazione citogenetica
18q23
Coordinate
Cromosoma 18: 79.964.643–79.970.822 (GRCh38)
Esoni
4 esoni su 6,2 kb
Proteina
74 amminoacidi
Noto anche come
FLJ10967, MGC189743
Trascritto MANE Select
ENST00000451882.3NM_001136180.2
Tipo di locus
Codificanti per proteine
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora HSBP1L1. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di HSBP1L1

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 18, con una parentesi dove si trova HSBP1L1. HSBP1L1 e 9 geni nelle vicinanze sul cromosoma 18, da 79.467.733 a 80.467.732.Cromosoma 1818q23p11.32p11.31p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q2379,6 Mb79,8 Mb80 Mb80,2 Mb80,4 MbNFATC1: 79.395.856–79.531.338, filamento direttoNFATC1CTDP1: 79.679.781–79.756.608, filamento direttoCTDP1KCNG2: 79.797.904–79.900.184, filamento direttoKCNG2SLC66A2: 79.901.157–79.951.677, filamento inversoSLC66A2HSBP1L1: 79.964.643–79.970.822, filamento direttoHSBP1L1TXNL4A: 79.970.691–80.033.949, filamento inversoTXNL4A: 80.034.346–80.097.088, filamento direttoRBFA: 80.034.389–80.050.651, filamento direttoRBFAADNP2: 80.109.262–80.147.523, filamento direttoADNP2PARD6G: 80.157.232–80.247.594, filamento inversoPARD6GDiagramma di HSBP1L1: 4 esoni sul filamento diretto del cromosoma 18Esone 1: 79.964.643–79.964.786, 144 basiEsone 2: 79.966.612–79.966.678, 67 basiEsone 3: 79.968.089–79.968.183, 95 basiEsone 4: 79.970.440–79.970.822, 383 basi12345′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 0,7 kb dei 6,2 kb del gene; 225 di queste basi codificano la proteina.

Sequenziamento di HSBP1L1

2Bassa

Quanto è difficile sequenziare HSBP1L1 con letture corte, su 100

  • Mappabilità0%
  • Omologia0%
  • Ripetizioni0%
  • Contenuto di GC21%
  • Copertura di riferimento0%

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.

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Dante Labs. (s.d.). Gene HSBP1L1: heat shock factor binding protein 1 like 1. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/hsbp1l1

Vancouver

Dante Labs. Gene HSBP1L1: heat shock factor binding protein 1 like 1 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/hsbp1l1

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