Il sequenziamento dell’intero genoma sta diventando lo standard di cura nella genetica clinica. I costi sono diminuiti drasticamente, la resa diagnostica continua a superare quella dei metodi di analisi meno recenti e questa tecnologia è ora accessibile anche ai singoli individui, non più soltanto agli istituti di ricerca. Tuttavia, la quantità di informazioni disponibili sul WGS può risultare difficile da gestire.
Questa guida illustra tutto ciò che deve sapere: che cos'è il sequenziamento dell'intero genoma, come funziona, quanto costa, quali informazioni può e non può fornire e come valutare i fornitori.
Che cos'è il sequenziamento dell'intero genoma?
Il sequenziamento dell’intero genoma (WGS) è un processo di laboratorio che determina la sequenza completa del DNA del genoma di un organismo, ovvero tutte le 6,4 miliardi di coppie di basi nel caso dell’essere umano. A differenza dei test genetici mirati, che analizzano porzioni di DNA preselezionate, il WGS legge tutto: ogni gene, ogni introne, ogni regione regolatrice e ogni tratto di DNA tra i geni.
Il risultato è una mappa digitale completa del Suo DNA. Con una profondità di grado clinico (copertura 30X), ogni posizione del Suo genoma viene letta in media 30 volte, garantendo un'accuratezza del 99,98%. Un risultato tipico identifica tra 4,6 e 5 milioni di varianti genetiche per individuo.
Come funziona
Il processo si articola in quattro fasi:
- Raccolta del campione: Un campione di saliva raccolto a casa utilizzando un kit inviato al Suo indirizzo. Non sono necessari né un prelievo di sangue né una visita in clinica.
- Estrazione e sequenziamento del DNA: Il campione viene processato in un laboratorio certificato, dove il DNA viene estratto e sequenziato mediante una tecnologia di sequenziamento di nuova generazione.
- Analisi bioinformatica: I dati grezzi del sequenziamento vengono allineati al genoma umano di riferimento, le varianti vengono rilevate (identificate) e ciascuna variante viene classificata secondo le linee guida dell'ACMG (American College of Medical Genetics).
- Generazione dei referti: I risultati clinicamente rilevanti vengono organizzati in referti destinati ai medici, suddivisi per specifiche categorie di salute, tra cui tumori ereditari, patologie cardiovascolari e neurologiche, farmacogenomica, malattie rare e altro ancora.
Cosa può rivelarle il WGS
Un sequenziamento completo dell’intero genoma può fornire informazioni in diversi ambiti clinici:
- Rischio di tumori ereditari: Varianti in geni come BRCA1, BRCA2, TP53 e nei geni associati alla sindrome di Lynch (MLH1, MSH2, MSH6, PMS2) che aumentano la predisposizione ai tumori.
- Rischio cardiovascolare: Varianti genetiche associate a condizioni quali ipercolesterolemia familiare, cardiomiopatie e aritmie.
- Farmacogenomica: Varianti che influenzano il modo in cui l'organismo metabolizza determinati farmaci, indicando quali medicinali hanno maggiori probabilità di essere efficaci, quali richiedono un aggiustamento del dosaggio e quali dovrebbero essere evitati.
- Diagnosi delle malattie rare: Per i pazienti alle prese con un’«odissea diagnostica», il sequenziamento dell’intero genoma (WGS) può identificare varianti in geni che nessun test mirato è stato progettato per analizzare, con una resa diagnostica del 25–50%.
- Stato di portatore: Indica se Lei è portatore di varianti associate a patologie recessive (come la fibrosi cistica o l’anemia falciforme) che potrebbero interessare i Suoi futuri figli.
- Patologie neurologiche: Fattori genetici associati a patologie come la malattia di Alzheimer, la malattia di Parkinson e l'epilessia.
Cosa non può dirle il WGS
Il sequenziamento dell'intero genoma è uno strumento potente, ma presenta importanti limitazioni:
- Non diagnostica patologie. Identifica varianti genetiche. La diagnosi richiede l'interpretazione clinica da parte di un medico, che valuti i sintomi, l'anamnesi personale e familiare insieme ai risultati genomici.
- Non tutte le varianti sono comprese. Circa il 50% delle varianti identificate è classificato come «variante di significato incerto» (VUS), il che significa che non esistono ancora prove scientifiche sufficienti per determinarne l'impatto clinico.
- Non misura l’espressione genica. Il WGS mostra ciò che è presente nel Suo DNA, non quali geni sono attualmente attivi. Il sequenziamento dell’RNA (trascrittomica) risponde a questa domanda distinta.
- I fattori ambientali non vengono rilevati. Alimentazione, stile di vita, esposizione a fattori ambientali e cambiamenti epigenetici influiscono tutti sulla salute e non sono rispecchiati nella sequenza del DNA.
Quanto costa nel 2026
Il costo del sequenziamento dell’intero genoma è sceso da circa 100 milioni di dollari nel 2001 a meno di 500 dollari nel 2026 per un sequenziamento 30X di grado clinico. Il prezzo include il sequenziamento, l’analisi bioinformatica e la refertazione clinica.
Con Dante Labs, il Genome Test include oltre 200 referti clinici disponibili tramite la piattaforma Genome Manager, con aggiornamenti dei referti a vita man mano che la scienza progredisce.
Vale la pena notare che la WGS è sempre più spesso coperta, in tutto o in parte, dai piani sanitari in determinati scenari clinici, in particolare per la diagnosi delle malattie rare e lo screening dei tumori ereditari. Verifichi con il Suo fornitore di assistenza sanitaria le attuali condizioni di copertura.
Come valutare un fornitore di WGS
Non tutti i servizi di sequenziamento dell’intero genoma sono equivalenti. Quando valuta i fornitori, consideri:
- Profondità di sequenziamento: Il WGS di grado clinico richiede una copertura minima di 30X. Una copertura inferiore riduce l'accuratezza e la capacità di rilevare le varianti.
- Accreditamento del laboratorio: Verifichi la presenza della certificazione CLIA, dell'accreditamento CAP o dell'accreditamento dei laboratori medici ISO 15189, gli standard utilizzati per i test diagnostici clinici.
- Qualità dei referti: I referti devono essere comprensibili per i medici, utilizzare la classificazione ACMG delle varianti e coprire più ambiti clinici, non solo l'ascendenza o i tratti genetici.
- Protezione dei dati: Verifichi dove vengono trattati i Suoi dati (la giurisdizione è importante), se il fornitore vende i dati a terzi e se può richiederne la cancellazione definitiva.
- Aggiornamenti dei report: Poiché la scienza genomica progredisce ogni anno, verifichi se il fornitore offre la rianalisi automatica e l'aggiornamento dei report man mano che vengono convalidate nuove associazioni tra varianti e malattie.
- Accesso ai dati grezzi: Dovrebbe poter scaricare in qualsiasi momento tutti i Suoi dati grezzi (file FASTQ/BAM/VCF).
Chi dovrebbe prendere in considerazione il sequenziamento dell’intero genoma?
Il WGS è indicato per un'ampia gamma di persone:
- Persone con una storia familiare di cancro, malattie cardiache, patologie neurologiche o altre malattie ereditarie che desiderano comprendere il proprio rischio.
- Pazienti alle prese con un lungo percorso diagnostico che non sono riusciti a ottenere una diagnosi tramite gli esami convenzionali.
- Persone per le quali il trattamento non sta funzionando — le informazioni farmacogenomiche possono spiegarne il motivo e orientare verso alternative.
- Persone proattive che desiderano avere il quadro più completo possibile della propria salute genetica, prima che sintomi o diagnosi le costringano ad affrontare la questione.
- Persone che hanno già effettuato un test del DNA per uso personale e desiderano passare a un sequenziamento completo di livello clinico.
Per iniziare
Il processo è semplice: ordini un kit, raccolga a casa un campione di saliva, lo rispedisca utilizzando l’etichetta di reso prepagata e acceda ai risultati tramite Genome Manager entro 6–8 settimane. Non sono necessari né una visita in clinica né l’impegnativa del medico.
Una volta sequenziato il Suo genoma, i Suoi dati rimangono disponibili in modo permanente. I Suoi report si aggiornano automaticamente con il progredire della scienza. Inoltre, il Suo profilo genetico completo sarà a Sua disposizione per tutta la vita, così come a disposizione di qualsiasi medico con cui deciderà di condividerlo.