Gene
ZC2HC1C
zinc finger C2HC-type containing 1C
- HGNC 20354↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000119703↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 79696↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 14q24.3
- Coordinate
- Cromosoma 14: 75.069.641–75.079.988 (GRCh38)
- Esoni
- 3 esoni su 10,3 kb
- Proteina
- 456 amminoacidi
- Simboli precedenti
- C14orf140, FAM164C
- Trascritto MANE Select
- ENST00000524913.3NM_024643.4
- Tipo di locus
- Codificanti per proteine
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
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page$gene$nameLegga ZC2HC1C e il resto del suo genoma con un unico test.
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Nessun report del Genome Test legge ancora ZC2HC1C. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.
Struttura di ZC2HC1C
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 3,9 kb dei 10,3 kb del gene; 1371 di queste basi codificano la proteina.
Sequenziamento di ZC2HC1C
0Bassa
Quanto è difficile sequenziare ZC2HC1C con letture corte, su 100Ogni barra indica la quota di basi degli esoni di ZC2HC1C che si trovano in quel tipo di regione difficile. Il punteggio le pondera in base a quanto ciascuna pesa su una chiamata con letture corte: 0 quando nessuna base si trova in una regione di questo tipo, 100 quando ogni base si trova in tutte.
- MappabilitàTratti in cui le letture da 100 o 250 bp non possono essere collocate in modo univoco, quindi una chiamata in quelle zone potrebbe mancare o essere errata. Peso 35%.0%
- OmologiaDuplicazioni segmentali: copie altrove nel genoma, come paraloghi e pseudogeni, con identità del 90% o superiore. Peso 30%.0%
- RipetizioniRipetizioni in tandem e sequenze di una stessa base ripetuta, su cui le letture tendono a scivolare e che potrebbero non essere coperte per intero. Peso 15%.2,5%
- Contenuto di GCFinestre con meno del 25% o più del 65% di G e C, che la preparazione della libreria copre con difficoltà. Peso 10%.1,1%
- Copertura di riferimentoLacune nell'assemblaggio di riferimento vicine, dove non c'è una sequenza a cui le letture possano allinearsi. Peso 10%.0%
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene ZC2HC1C: zinc finger C2HC-type containing 1C. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/zc2hc1c
Dante Labs. Gene ZC2HC1C: zinc finger C2HC-type containing 1C [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/zc2hc1c
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