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Gene

OR52N5

olfactory receptor family 52 subfamily N member 5

Sintesi

Localizzazione citogenetica
11p15.4
Coordinate
Cromosoma 11: 5.776.165–5.783.355 (GRCh38)
Esoni
3 esoni su 7,2 kb
Proteina
324 amminoacidi
Noto anche come
OR52N5Q
Trascritto MANE Select
ENST00000641181.1NM_001385662.1
Tipo di locus
Codificanti per proteine
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora OR52N5. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di OR52N5

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
Cromosoma 11, con una parentesi dove si trova OR52N5. OR52N5 e 43 geni nelle vicinanze sul cromosoma 11, da 5.279.760 a 6.279.759.Cromosoma 1111p15.4p15.5p15.4p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12p11.2p11.12p11.11q11q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q13.4q13.5q14.1q14.2q14.3q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q255,4 Mb5,6 Mb5,8 Mb6 Mb6,2 MbHBG2: 5.253.188–5.505.605, filamento inverso: 5.254.392–5.678.434, filamento inversoHBE1: 5.268.345–5.505.652, filamento inversoOR51B4: 5.301.014–5.301.946, filamento inversoOR51B5: 5.303.444–5.505.652, filamento inversoOR51B2: 5.323.359–5.324.297, filamento inversoOR51B6: 5.351.508–5.352.446, filamento direttoOR51M1: 5.383.812–5.393.263, filamento direttoOR51Q1: 5.422.111–5.423.206, filamento direttoOR51Q1OR51I1: 5.440.570–5.441.514, filamento inversoOR51I1OR51I2: 5.449.323–5.456.518, filamento direttoOR51I2OR52D1: 5.488.685–5.489.749, filamento direttoOR52D1UBQLN3: 5.507.300–5.509.958, filamento inversoUBQLN3UBQLNL: 5.514.393–5.518.431, filamento inversoUBQLNLOR52H1: 5.544.489–5.548.540, filamento inversoOR52H1OR52B6: 5.580.877–5.581.884, filamento direttoOR52B6TRIM6: 5.596.109–5.612.958, filamento direttoTRIM6TRIM6-TRIM34: 5.596.725–5.644.398, filamento direttoTRIM6-TRIM34TRIM34: 5.619.764–5.644.398, filamento direttoTRIM34TRIM5: 5.663.195–5.938.619, filamento inversoTRIM5TRIM22: 5.689.610–5.737.089, filamento direttoTRIM22OR52P1: 5.726.502–5.727.464, filamento direttoOR56B1: 5.736.448–5.738.523, filamento direttoOR52N4: 5.754.243–5.755.958, filamento direttoOR56B2: 5.761.153–5.769.080, filamento direttoOR56B2OR52N5: 5.776.165–5.783.355, filamento inversoOR52N5OR52N1: 5.786.471–5.791.265, filamento inversoOR52N1OR52N2: 5.808.911–5.821.492, filamento direttoOR52E6: 5.840.928–5.841.952, filamento inversoOR52E6OR52E8: 5.856.749–5.857.690, filamento inversoOR52E8OR52E4: 5.880.629–5.887.079, filamento direttoOR52E4OR52E5: 5.893.208–5.902.730, filamento direttoOR56A3: 5.938.751–5.951.347, filamento direttoOR56A3OR56A5: 5.967.553–5.968.494, filamento inversoOR56A5OR52L1: 5.985.892–5.986.985, filamento inversoOR52L1OR56A4: 5.999.445–6.006.946, filamento inversoOR56A4OR56A1: 6.019.336–6.034.338, filamento inversoOR56A1OR56B4: 6.107.684–6.108.835, filamento direttoOR56B4OR52B2: 6.169.355–6.170.326, filamento inversoOR52B2OR52W1: 6.199.224–6.200.186, filamento direttoOR52W1C11orf42: 6.205.557–6.211.135, filamento direttoC11orf42FHIP1B: 6.211.334–6.234.711, filamento inversoFHIP1BCNGA4: 6.234.765–6.245.922, filamento direttoCNGA4CCKBR: 6.259.698–6.272.127, filamento direttoCCKBRDiagramma di OR52N5: 3 esoni sul filamento inverso del cromosoma 11Esone 3: 5.776.165–5.778.657, 2493 basiEsone 2: 5.781.533–5.781.756, 224 basiEsone 1: 5.783.295–5.783.355, 61 basi3215′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 2,8 kb dei 7,2 kb del gene; 975 di queste basi codificano la proteina.

Sequenziamento di OR52N5

2Facile

Quanto è difficile sequenziare OR52N5 con letture corte, su 100

Quasi tutti gli esoni di OR52N5 si trovano in regioni in cui le letture corte si allineano in modo chiaro.

A ciò si aggiunge: la quota di esoni di OR52N5 in ciascun tipo di regione difficile

  • Mappabilità0%
  • Omologia0%
  • Ripetizioni4,8%
  • Contenuto GC12%
  • Copertura del riferimento0%

Un punteggio di Dante Labs basato su nostre ricerche, costruito sulle mappe delle regioni difficili da sequenziare di NIST Genome in a Bottle.Come viene calcolato

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.

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Dante Labs. (s.d.). Gene OR52N5: olfactory receptor family 52 subfamily N member 5. Consultato il 18 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/or52n5

Vancouver

Dante Labs. Gene OR52N5: olfactory receptor family 52 subfamily N member 5 [Internet]. [citato il 18 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/or52n5

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