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Gene

LHX5

LIM homeobox 5

Sintesi

Localizzazione citogenetica
12q24.13
Coordinate
Cromosoma 12: 113.462.033–113.471.871 (GRCh38)
Esoni
5 esoni su 9,8 kb
Proteina
402 amminoacidi
Trascritto MANE Select
ENST00000261731.4NM_022363.3
Tipo di locus
Codificanti per proteine
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora LHX5. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di LHX5

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
Cromosoma 12, con una parentesi dove si trova LHX5. LHX5 e 14 geni nelle vicinanze sul cromosoma 12, da 112.966.952 a 113.966.951.Cromosoma 1212q24.13p13.33p13.32p13.31p13.2p13.1p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.31q24.32q24.33113 Mb113,2 Mb113,4 Mb113,6 Mb113,8 MbOAS3: 112.938.051–112.976.460, filamento direttoOAS3OAS2: 112.978.387–113.011.723, filamento direttoOAS2DTX1: 113.056.679–113.098.028, filamento direttoDTX1RASAL1: 113.096.515–113.136.262, filamento inversoRASAL1CFAP73: 113.149.709–113.159.526, filamento direttoCFAP73DDX54: 113.157.173–113.185.508, filamento inversoDDX54RITA1: 113.185.045–113.193.653, filamento direttoRITA1DRC10: 113.192.309–113.221.103, filamento inversoDRC10TPCN1: 113.221.050–113.301.325, filamento direttoTPCN1SLC8B1: 113.298.759–113.359.502, filamento inversoSLC8B1PLBD2: 113.358.543–113.391.629, filamento direttoPLBD2SDS: 113.392.423–113.426.301, filamento inversoSDSSDSL: 113.409.798–113.438.395, filamento direttoSDSLLHX5: 113.462.033–113.471.871, filamento inversoLHX5RBM19: 113.795.725–113.966.367, filamento inversoRBM19Diagramma di LHX5: 5 esoni sul filamento inverso del cromosoma 12Esone 5: 113.462.033–113.463.557, 1525 basiEsone 4: 113.467.256–113.467.421, 166 basiEsone 3: 113.468.127–113.468.404, 278 basiEsone 2: 113.469.122–113.469.345, 224 basiEsone 1: 113.471.326–113.471.871, 546 basi543215′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 2,7 kb dei 9,8 kb del gene; 1209 di queste basi codificano la proteina.

Sequenziamento di LHX5

8Bassa

Quanto è difficile sequenziare LHX5 con letture corte, su 100

  • Mappabilità0%
  • Omologia0%
  • Ripetizioni8,8%
  • Contenuto di GC64%
  • Copertura di riferimento0%

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.

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Dante Labs. (s.d.). Gene LHX5: LIM homeobox 5. Consultato il 18 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/lhx5

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Dante Labs. Gene LHX5: LIM homeobox 5 [Internet]. [citato il 18 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/lhx5

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