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Gene

KIAA0408

KIAA0408

Sintesi

Localizzazione citogenetica
6q22.33
Coordinate
Cromosoma 6: 127.438.406–127.459.389 (GRCh38)
Esoni
6 esoni su 21 kb
Proteina
694 amminoacidi
Trascritto MANE Select
ENST00000483725.8NM_014702.5
Tipo di locus
Codificanti per proteine
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora KIAA0408. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di KIAA0408

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 6, con una parentesi dove si trova KIAA0408. KIAA0408 e 7 geni nelle vicinanze sul cromosoma 6, da 126.948.898 a 127.948.897.Cromosoma 66q22.33p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q27127 Mb127,2 Mb127,4 Mb127,6 Mb127,8 MbRSPO3: 127.118.658–127.199.481, filamento direttoRSPO3RNF146: 127.266.582–127.290.408, filamento direttoRNF146ECHDC1: 127.288.710–127.343.609, filamento inversoECHDC1KIAA0408: 127.438.406–127.459.389, filamento inversoKIAA0408: 127.438.406–127.519.001, filamento inversoMTCL3: 127.467.569–127.519.383, filamento inversoMTCL3C6orf58: 127.519.455–127.591.820, filamento direttoC6orf58THEMIS: 127.706.178–127.918.631, filamento inversoTHEMISDiagramma di KIAA0408: 6 esoni sul filamento inverso del cromosoma 6Esone 6: 127.438.406–127.444.282, 5877 basiEsone 5: 127.446.408–127.447.740, 1333 basiEsone 4: 127.449.822–127.449.901, 80 basiEsone 3: 127.449.990–127.450.352, 363 basiEsone 2: 127.453.847–127.454.101, 255 basiEsone 1: 127.459.175–127.459.389, 215 basi64215′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 8,1 kb dei 21 kb del gene; 2085 di queste basi codificano la proteina.

Sequenziamento di KIAA0408

3Facile

Quanto è difficile sequenziare KIAA0408 con letture corte, su 100

Quasi tutti gli esoni di KIAA0408 si trovano in regioni in cui le letture corte si allineano in modo chiaro.

A ciò si aggiunge: la quota di esoni di KIAA0408 in ciascun tipo di regione difficile

  • Mappabilità0,6%
  • Omologia0%
  • Shared with chrY0%
  • Copertura del riferimento0%
  • Ripetizioni3,7%
  • Contenuto GC6,1%

Un punteggio di Dante Labs basato su nostre ricerche, costruito sulle mappe delle regioni difficili da sequenziare di NIST Genome in a Bottle.Come viene calcolato

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.

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Dante Labs. (s.d.). Gene KIAA0408: KIAA0408. Consultato il 19 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/kiaa0408

Vancouver

Dante Labs. Gene KIAA0408: KIAA0408 [Internet]. [citato il 19 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/kiaa0408

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