Gene
FAM163A
family with sequence similarity 163 member A
- HGNC 28274↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000143340↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 148753↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 1q25.2
- Coordinate
- Cromosoma 1: 179.743.291–179.816.198 (GRCh38)
- Esoni
- 5 esoni su 72,9 kb
- Proteina
- 167 amminoacidi
- Noto anche come
- MGC16664, NDSP
- Simboli precedenti
- C1orf76
- Trascritto MANE Select
- ENST00000341785.5NM_173509.3
- Tipo di locus
- Codificanti per proteine
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
Questa pagina come dati
Aggiunga .json all'indirizzo della pagina, oppure richieda application/json, per leggerla come JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/fam163a.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLegga FAM163A e il resto del suo genoma con un unico test.
A partire da 449 $Spedizione gratuita · Risultati in 6–8 settimane
Ottieni il mio Genome TestReport curati rilevanti per questo gene
Nessun report del Genome Test legge ancora FAM163A. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.
Struttura di FAM163A
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 2,8 kb dei 72,9 kb del gene; 504 di queste basi codificano la proteina.
Sequenziamento di FAM163A
2Bassa
Quanto è difficile sequenziare FAM163A con letture corte, su 100Ogni barra indica la quota di basi degli esoni di FAM163A che si trovano in quel tipo di regione difficile. Il punteggio le pondera in base a quanto ciascuna pesa su una chiamata con letture corte: 0 quando nessuna base si trova in una regione di questo tipo, 100 quando ogni base si trova in tutte.
- MappabilitàTratti in cui le letture da 100 o 250 bp non possono essere collocate in modo univoco, quindi una chiamata in quelle zone potrebbe mancare o essere errata. Peso 35%.0%
- OmologiaDuplicazioni segmentali: copie altrove nel genoma, come paraloghi e pseudogeni, con identità del 90% o superiore. Peso 30%.0%
- RipetizioniRipetizioni in tandem e sequenze di una stessa base ripetuta, su cui le letture tendono a scivolare e che potrebbero non essere coperte per intero. Peso 15%.2,4%
- Contenuto di GCFinestre con meno del 25% o più del 65% di G e C, che la preparazione della libreria copre con difficoltà. Peso 10%.15%
- Copertura di riferimentoLacune nell'assemblaggio di riferimento vicine, dove non c'è una sequenza a cui le letture possano allinearsi. Peso 10%.0%
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene FAM163A: family with sequence similarity 163 member A. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/fam163a
Dante Labs. Gene FAM163A: family with sequence similarity 163 member A [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/fam163a
Un solo test. Risposte per tutta la vita.
A partire da 449 $Spedizione gratuita · Risultati in 6–8 settimane